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SNPのジェノタイピングの手法（Taqman or サンガ―法） トピック削除
No.11793-TOPIC - 2023/09/21 (木) 12:05:56 - sample
脳病理で蛋白の発見量を評価する研究をしているですが、とあるSNPの違いによって、蛋白発現量の有無を評価したいです。

実際には凍結脳組織からDNAの抽出を行い、そこからSNPのジェノタイピングを60個体程度行いたいと考えております。

そこでSNPのジェノタイピングの方法を調べると
➀サンガ―法による解析
➁TaqMan SNP genotyping
の2種類が一般的の様ですが、どちらの方がいいのか、精度・簡便性・コストの観点から教えていただけつと幸いです、
　
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(無題) 削除/引用
No.11793-2 - 2023/09/25 (月) 15:26:42 - lala
Taqmanの方が速くできると思います。
サンガ―法で60サンプル行うのは根性が必要ですね。
コストはサイクルシークエンスするので、サンガ―法は安いとも限らないですよね。

SNPのジェノタイピングの手法（Taqman or サンガ―法） 削除/引用
No.11793-1 - 2023/09/21 (木) 12:05:56 - sample
脳病理で蛋白の発見量を評価する研究をしているですが、とあるSNPの違いによって、蛋白発現量の有無を評価したいです。

実際には凍結脳組織からDNAの抽出を行い、そこからSNPのジェノタイピングを60個体程度行いたいと考えております。

そこでSNPのジェノタイピングの方法を調べると
➀サンガ―法による解析
➁TaqMan SNP genotyping
の2種類が一般的の様ですが、どちらの方がいいのか、精度・簡便性・コストの観点から教えていただけつと幸いです、
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