Bio Technical フォーラム

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No.11755-TOPIC - 2023/09/02 (土) 15:01:31 - るみ
 あるタンパク(転写因子)にタグを付加してChip-seqを行おうとしています。タグを付加する位置をN末にするかC末にするかはどのようにして決定するのが良いでしょうか。教えてもらえると嬉しいです。
 
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No.11755-4 - 2023/09/03 (日) 12:15:20 - るみ
ご回答どうも有難う御座います。
N末とC末両方作成して検討するほうがよさそうですね。
大変参考になりました。

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No.11755-3 - 2023/09/03 (日) 08:33:41 - おお
目的の活性を維持している方を使う。
転写因子で、既知のターゲットがあるとか、レポータープラスミドが存在するなら、両方作ってどちらに活性があるか確認するといい。そんな手間とも思えないし。

もちろん今までの世に出ている論文をしらべてもいいけど。自身の系で結論が出せるならそれがベストではないかとも思う。

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No.11755-2 - 2023/09/02 (土) 16:58:14 - 独り言
過去のそのタンパク質を用いてる論文を調べて、NまつかC末かどちらが多く使用されているか、自分の実験の目的にはどちらがわが使用されているか調べましょう。Pubmedだと、本文検索できないので、google scholarを使用すると調べやすい。

もし、過去に文献がないのであれば、自分で両方試して、機能が阻害されていないほうを使用する。

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No.11755-1 - 2023/09/02 (土) 15:01:31 - るみ
 あるタンパク(転写因子)にタグを付加してChip-seqを行おうとしています。タグを付加する位置をN末にするかC末にするかはどのようにして決定するのが良いでしょうか。教えてもらえると嬉しいです。

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