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(無題) 削除/引用 No.11652-7 - 2023/07/26 (水) 06:52:33 - おお >[Re:5] momoさんは書きました : > 昔はMupidのトレーにアクリルアミドゲル作製用のフタが付いていましたが今は無いのかな。私自身は使ったことはありませんが、あれだとゲル板を立てるよりは楽かも。 あ、これもう売ってないらしい。アイデアのわりにゲルの出来が良くないっていう感じの話をきいた。それで売らなくなったらしい。

(無題) 削除/引用 No.11652-6 - 2023/07/26 (水) 02:17:02 - mupid 使ってるのはアガロース。 コストは厳密に比較してないけど 見たい大きさやサンプル数、論文に掲載したい画や 記録のフォーマット、サイズ統一感 諸々考えて各々選択するから これがベストというものはないかな。 選択肢としては アガロース アクリルアミドの他には キャピラリーくらい？ キャピラリーはバンド画像がLaneごとに分かれるし メンテ考えるとよほど急ぎでサンプルが多くないと 嫌われてるイメージ。 あまり数百レベルで比較はしないから高濃度とかは知らないけど アガロースはコームの種類が豊富だから シャープにしたければ極細にすれば見え方も変わるし サンプル多ければ１ゲル途中にもう一本刺せば 量２倍・泳動半分にしたりカスタマイズはしやすい

(無題) 削除/引用 No.11652-5 - 2023/07/25 (火) 16:22:22 - momo 昔はMupidのトレーにアクリルアミドゲル作製用のフタが付いていましたが今は無いのかな。私自身は使ったことはありませんが、あれだとゲル板を立てるよりは楽かも。

(無題) 削除/引用 No.11652-4 - 2023/07/25 (火) 15:54:45 - 2ME Mupidが無かった頃ですが、数百pbのDNAは普通にアクリルアミドゲルで泳動していました。エチブロの後染めです。今と比べると悠長な時代だったかもしれません。今はアガロースゲル一択ですね。アガロース一択になったのはMupidの存在もあるかもしれません。 確かにアガロースの方がアクリルアミドよりも5倍ぐらい値段が高いですね。とはいえ、ラボ全体の経費に占めるアガロースの割合を考えると、電気泳動の一部をアガロースからアクリルアミドに切り替えるほどではないのかもしれません。ラボの経済力にもよるでしょうが。 アクリルアミドゲルを作るのは煩わしい感じはしますが、タンパク質の電気泳動の場合は、多少面倒でも普通にアクリルアミドゲルを使いますからね。アクリルアミドゲルが面倒だからといってアガロースゲルでタンパク質の電気泳動をする人は少ないのではないでしょうか。DNAとタンパク質は違うと言われるかもしれませんが。 言われてみれば、よくわからないですね。結局は気持ちの問題、慣れの問題といったところでしょうか？

(無題) 削除/引用 No.11652-3 - 2023/07/25 (火) 13:20:38 - あ 普段使いはアガロース一択です。 簡単で早いし流動途中でもわかるから。殆どの人がそうだと思います。 アクリルアミドは微妙な大小を比べる時しか使いません。そこまでの分解能が入りません。

(無題) 削除/引用 No.11652-2 - 2023/07/25 (火) 09:05:37 - TS 私もアガロースゲルですね。うちはアクリルアミドゲルも自作なんですけど、そうなるとアクリルアミドゲルの方が流すまでの準備とか手間かなぁと（まぁ学生がやるんでいいんですが）。アガロースだと、良いか悪いか、泳動層やTAEとかも出しっぱなしですぐに使えたり、ゲルもまとめて作ってあれば、冷蔵庫から出してすぐに使えるし。DNA用のアクリルアミドゲルの市販品があるか知らないですが、お金もあって市販品を使えれば確かに楽かなとは思います。もちろん分離能も良いし。

PCR産物の電気泳動 削除/引用 No.11652-1 - 2023/07/25 (火) 02:59:08 - おお PCR産物は実験によるでしょうけど、１００ｂｐとか数百ベースのものを見ることも多いと思います。そうすると高価なアガロースで高い濃度で電気泳動することになるかと思いますが、私は（具体的計算はしてないけど）アクリルアミドゲルで流したほうが安くつくと思うし、分解能もいい（うまくやれば１ベースのさも見れる、ミニゲルではちょっと無理かもだけど）し副産物とかの誤認も減ると思ってます。 でも一般的にはやはりアガロース使ってるのが現状ですかね。。。というところがなんかどうなってるのかなと思うのですが。皆さんはどうしてますか？

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