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(無題) 削除/引用 No.11541-5 - 2023/06/24 (土) 15:44:33 - qqq 杏里さま 確かにMGBプローブなら8-30bpまでOKということで、ぎりぎり何とかなりそうです。気づきませんでした。。 ありがとうございます。一度試してみます。

(無題) 削除/引用 No.11541-4 - 2023/06/23 (金) 22:00:15 - 杏里 MGB(Minor Groove Binder)のクエンチャーを使うのならその位に短いプローブもあり得ます。 バリアントが色々とあるターゲットから保存領域を選んでプローブ設計する時（新型コロナウイルスとか）など、制約のあるqPCRの設計の際に便利です。

(無題) 削除/引用 No.11541-3 - 2023/06/22 (木) 18:21:37 - qqq おおさま やはりそうですか。 一応、論文のグループに問い合わせしてみました。 ありがとうございます。

(無題) 削除/引用 No.11541-2 - 2023/06/21 (水) 15:57:17 - おお その論文見ました。全く同じようにやって検出されないと言うことのようですね。。。 その論文のグループに問い合わせてもいいかもしれませんね。単純に誤植だったりするかもです。

リアルタイムPCRのプローブの長さについて 削除/引用 No.11541-1 - 2023/06/20 (火) 21:42:19 - qqq リアルタイムPCRに使用するプローブ(Taqmanprobe)について教えてください。 プライマー/プローブを設計する際、通常はプライマーよりもプローブの方がTm値を高くする必要があるため、多くの場合は、プローブの長さ＞プライマーの長さになるかと思いますが、微生物の特異的な定量を目的としたある論文では、プローブの長さがプライマーの長さの半分以下になっていました。 このような条件はあり得るでしょうか？ (この論文通り実験を行ったところ、案の定、蛍光が全く検出できませんでした) 具体的には、下記詳細になります。 ・Forward primer CATCGTTCGTCAGCAGTAACA ・Reverse primer CCAAGAAAAAGGGACAGTGG ・Probe FAM-ACCTGCTG-NFQ (温度条件※酵素はTaqMan Universal PCR Master Mix) 95℃　15min 94℃　15s 60℃　1min プライマープローブ条件以外に特におかしな点はありませんでした。 どうぞよろしくお願いいたします。

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