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タンパク質のサイズ
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No.11514-TOPIC - 2023/06/13 (火) 03:36:13 - マウス初心者
現在いる教室で独自に樹立した間質細胞株と293細胞を用いてタンパク質XをWBしているのですが、WBで検出されるタンパク質のサイズが細胞間で異なる(間質細胞では45KDa付近, 293細胞では60付近)のですが、 よくあることなのでしょうか?自分の知識がなくて恐縮なのですが、理由も教えていただければありがたいです。
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No.11514-7 - 2023/06/13 (火) 07:07:33 - マウス初心者
ありがとうございました。
(無題)
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No.11514-6 - 2023/06/13 (火) 06:57:29 - マウス初心者
皆様お返事ありがとうございます。
ご指摘の通り、間質細胞株はマウス由来です。
説明よく分かりました。ありがとうございました。
(無題)
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No.11514-5 - 2023/06/13 (火) 06:00:00 - 774R
糖鎖付加されるタンパク質は、細胞種の違いで移動度が変わることはよく経験しますね。
(無題)
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No.11514-4 - 2023/06/13 (火) 05:26:23 - おお
あ、マウスとは書いてないですね、、、
(無題)
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No.11514-3 - 2023/06/13 (火) 05:16:15 - おお
人とマウスということなので、それぞれの全長も考慮に入れるべきかもしれません。また人とマウスの間で若干の配列の違いが移動度に影響することもあると思います。
(無題)
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No.11514-2 - 2023/06/13 (火) 05:14:28 - おお
よくあることというには、どの程度をよくあるというのかという点であまりScientificでないのでYes-Noで答えずらいですが、
あってもおかしくないことと思っています。
タンパクのサイズに影響するのはModification、プロテアーゼなどによるプロセッシング、ゲノムからの発現ならスプライシングバリアントなどです。まれに構造的なものも含まれます。さらに抗体が認識する部位によっても見え方が違ってきたりもします。
https://www.researchgate.net/figure/Western-blot-gels-for-the-two-EGFR-antibodies-and-the-COX-2-antibody-A-Two-bands-were_fig1_258202546
こちらではCox2が66kDa と 74kDaに検出され癌で74kDaがドミナント(場合によっては66kDaが検出されないが、mucosaでは74kDaは検出されない。
https://www.technologynetworks.com/proteomics/articles/why-does-the-molecular-weight-of-my-protein-differ-from-the-theoretically-expected-weight-322079
こちらではサイズが違って見える理由などを解説しています。
ただし、特定の組織、細胞だけノンスぺが出やすいというのもあり得るかと思うので、注意は必要かと思います。
タンパク質のサイズ
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No.11514-1 - 2023/06/13 (火) 03:36:13 - マウス初心者
現在いる教室で独自に樹立した間質細胞株と293細胞を用いてタンパク質XをWBしているのですが、WBで検出されるタンパク質のサイズが細胞間で異なる(間質細胞では45KDa付近, 293細胞では60付近)のですが、 よくあることなのでしょうか?自分の知識がなくて恐縮なのですが、理由も教えていただければありがたいです。
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