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(無題) 削除/引用 No.11489-2 - 2023/06/03 (土) 11:29:24 - toto ８bitでautoscaleではなくて、色をsplitしたあとでMakeBinaryを使うのがきもと思いますが、適当な画像でちょっとやってみたところ、IHCの画像に対して正確に数を数えてくれるマクロを組むのは手間がかかりそうです。ですが、すでに既存のpluginがいくつもでてますので、それを入れた方が早くて正確さもそれなりにできるようです。 //imagej.nih.gov/ij/plugins/ihc-toolbox/index.html 等は比較的使われていたような記憶があります。

Image Jのマクロ　8bitのthresholdについて 削除/引用 No.11489-1 - 2023/06/03 (土) 10:53:48 - gi Image Jで免疫組織化学の評価を行っています。 1視野あたりの陽性細胞の占める割合を8bitの二値処理で進めているのですが、サンプル数が多いためマクロをくんでみました。 やりたいこととしてはできているようなのですが、Thresholdの値がどうも反映されていないようです。 マクロ初心者で何が問題なのか皆目検討がつきません。 ご存知の方がおられましたらご教示いただけますとありがたいです。 よろしくお願いします。 画像を読み込んでからのコマンドはRecordすると以下のようになっています。 ＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝ run("8-bit"); setAutoThreshold("Default"); //run("Threshold..."); WaitForUser(); //setThreshold(0, 100); setOption("BlackBackground", false); run("Convert to Mask"); run("Convert to Mask"); run("Convert to Mask"); run("Analyze Particles...", "clear summarize"); ＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝

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