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GST-アクセプトの吸着力について トピック削除
No.11467-TOPIC - 2023/05/26 (金) 14:56:04 - あいうえお
アフィニティークロマトグラフィーにて、カラムによりGSTを除去する際、新品のGSTーアクセプトを用いた場合吸着力が非常に強いため、GST以外も吸着する可能性があると耳にしたことがあるが、今回実験において、新品を使用し、カラムに通したところ、12kDaの目的のタンパク質のバンドが出てこなかった野ですが、新品場合GST以外のタンパク質も吸着し、目的のタンパク質がカラムを通した後出てこないという事象は実験をする上で皆様よく起こり得りますか。
 
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(無題) 削除/引用
No.11467-4 - 2023/05/27 (土) 05:39:40 - あの
そのカラムではありませんが、ゲル濾過を少量のタンパクに対して実施する場合には、
必ず、BSA溶液を先に流す事をしています。

最近は、ビオチンや、蛍光色素で標識した後です。

以前は、ラジオアイソトープの125Iで標識した後に実施していました。この場合、
一度、BSAブロッキングをし忘れたときには、標識済みタンパクがカラムにトラップ
されていることがはっきりと、ガンマ線測定装置でしらべられました。

カラムの壁のプラスチックが、吸着するのだと思っています。

(無題) 削除/引用
No.11467-3 - 2023/05/27 (土) 02:07:52 - おお
>GSTーアクセプトを用いた場合吸着力が非常に強いため、

よくわからないですね。リガンドはグルタチオン、マトリックスは4%アガロースごく普通の他社でも作ってそうなもので、特別強いわけでもなさそうだし、言っている吸着力っていうのがリガンドへの吸着力というなら、Thrombinで切断した12kDaがリガンドについているというのは変だし、マトリックスの4%アガロースはそんなに吸着力があるものではなく(マトリクスにつかないようにふつうそういうものをつかう)それを吸着力が非常に強いというのは、はて、とおもう。ただしそれでも吸着してしまう事はなくはないので以下にそれを含めて書いておきます。

まず、ちゃんとビーズにそのGST-目的のタンパクはついていますか?吸着してなかったらビーズからは溶出できません(ちゃんと確認作業しているならお許しください)。

GST-目的のタンパクは、グルタチオンで溶出できますか?できないならアガロース担体に非特異的に吸着してしまっている可能性があります。

Thrombin で切断して溶出していると思われますが、ビーズから変性剤などで強制的に溶出したときに12kDaが検出されますか?

目的のタンパクの配列にThrombin認識部位がないですか?

実際まあまあの頻度であるのは、GSTを切断したとたんに可溶性が低下してビーズに非特異に吸着してしまうという事態です。吸着を防ぐためのブロッキングや溶出できるようなバッファーの工夫も対処する手段としてあります(まあいろいろやってダメだったということも結構あります)。

もしブロッキングするならBSAまたはPVPなどのポリマーですかねぇ。どれだけの事例でそれがうまくいっているのかわかりませんが。

(無題) 削除/引用
No.11467-2 - 2023/05/26 (金) 17:25:21 - abc
頻繁にはないですが、そういうこともありますよ。サンプルにBSAを入れるとか、カラムを一度ブロッキングするとか、吸着ではなく詰まって出てこないなら、カラムは使わずバッチにするとか。

GST-アクセプトの吸着力について 削除/引用
No.11467-1 - 2023/05/26 (金) 14:56:04 - あいうえお
アフィニティークロマトグラフィーにて、カラムによりGSTを除去する際、新品のGSTーアクセプトを用いた場合吸着力が非常に強いため、GST以外も吸着する可能性があると耳にしたことがあるが、今回実験において、新品を使用し、カラムに通したところ、12kDaの目的のタンパク質のバンドが出てこなかった野ですが、新品場合GST以外のタンパク質も吸着し、目的のタンパク質がカラムを通した後出てこないという事象は実験をする上で皆様よく起こり得りますか。

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