Bio Technical フォーラム

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分子量マーカーのトラブル トピック削除
No.11466-TOPIC - 2023/05/26 (金) 12:47:12 -
いつもお世話になっております。

ウエスタンブロットの電気泳動時に分子量マーカーを5μlアプライしているのですが、
電気泳動終了後に見てみるとwellの中に不均一(ギザギザ)に分子量マーカーが残っています。

また、GELを軽く洗浄する際にその分子量マーカーの残骸?が塊として出てきます。

同じような経験をお在りの方がいらっしゃいましたら、対処法を教えていただけないでしょうか?

Wellは泳動bufferで3回洗浄しております。

よろしくお願いいたします。
 
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No.11466-8 - 2023/05/27 (土) 01:40:02 - おお
シグマの商品の経験をもとに推測すると、

私が使ったことがあるシグマの製品は凍結乾燥した状態で納品されていました。溶かすにあたって尿素を入れるように書かれていましたが英語が読めないテクニシャンがサンプルバッファーでとかして泳動して、Wellにはつまらなかったものの高分子にすべてのマーカーが検出されて、アぐっているようでした。

おそらくマーカーに使う色素がアぐりやすい性質を持っているのだろうと思いますが、同じような色素を使ってた場合一部のマーカーたんぱくが色素を介してアぐっているかもしれません。その場合は5ug使っているとのことなので、それの同量の飽和尿素水を加えてから泳どうすると改善するかもしれません。

違う可能性としては未反応の色素が残っていてそれが沈殿している場合。遠心で除けるかもしれません。フィルターとかでもいいのかもしれませんが、わざわざそこまでしないといけないのか感があります。

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No.11466-7 - 2023/05/26 (金) 21:04:04 - G25
ボイルが必要ない製品ですが、ボイルしたとか?
Igのエピトープを含む他はどんなタンパク質かわかりませんけど、 ボイルでアグり易いとか、

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No.11466-6 - 2023/05/26 (金) 17:31:36 - あの
購入してから、凍結融解を沢山 繰り返していませんか?
凝集しているのでは?


対策は、遠心してから使う、あるいは、購入後に分注する、です

(無題) 削除/引用
No.11466-5 - 2023/05/26 (金) 16:49:38 - TS
わたしは使用したことないメーカーですが、特に前処理は必要ないようですね。テクニカルとかに問い合わせしましたか。そっちのマターと思います。

(無題) 削除/引用
No.11466-4 - 2023/05/26 (金) 15:26:20 -
ご回答いただきありがとうございます。

Beacle社のWestern Marker Neo(low)を使用しております。

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No.11466-3 - 2023/05/26 (金) 15:02:53 - おお
どの商品ですか?シグマの商品でちょっと癖があります。

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No.11466-2 - 2023/05/26 (金) 14:32:31 - abc
一度遠心してからアプライするか、2、3倍に薄めてアプライしてみては?

分子量マーカーのトラブル 削除/引用
No.11466-1 - 2023/05/26 (金) 12:47:12 -
いつもお世話になっております。

ウエスタンブロットの電気泳動時に分子量マーカーを5μlアプライしているのですが、
電気泳動終了後に見てみるとwellの中に不均一(ギザギザ)に分子量マーカーが残っています。

また、GELを軽く洗浄する際にその分子量マーカーの残骸?が塊として出てきます。

同じような経験をお在りの方がいらっしゃいましたら、対処法を教えていただけないでしょうか?

Wellは泳動bufferで3回洗浄しております。

よろしくお願いいたします。

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