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NGS ペアエンドシークエンシング
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No.11460-TOPIC - 2023/05/23 (火) 12:06:43 - ああ
NGSにおいて、150bpペアエンドシークエンシングがあるとおもいます。
ペアエンドシークエンシングの意味はわかるのですが、具体的にどこが150bpなのかわかりません。ちなみにインサートは300bpです。
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(無題)
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No.11460-7 - 2023/05/23 (火) 16:29:18 - 774R
では、300bpの話を忘れて書きます。
単純に、リード長を150bpとしてシーケンスするという意味だと思います。それを両側から行う。
(無題)
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No.11460-6 - 2023/05/23 (火) 16:25:05 - pp
アダプターの一番端にプライマーが結合して、インサートを150 basesまで読む、と理解しています。それが両側から読まれるので、例えば300 bpのインサートならば計算上、全長の配列が重複なく得られると。非専門家の雑な理解ですが。
(無題)
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No.11460-5 - 2023/05/23 (火) 15:56:11 - ああ
関係ないですけど、念のため書いておきました。
(無題)
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No.11460-4 - 2023/05/23 (火) 15:10:34 - 774R
そのインサート配列と、質問の最初に書かれていた150bpペアードシークエンシングとの関係は?
(無題)
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No.11460-3 - 2023/05/23 (火) 13:10:45 - ああ
インサートサイズです。
アダプターを付加したインサート配列のことです。
(無題)
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No.11460-2 - 2023/05/23 (火) 12:54:19 - 774R
>ちなみにインサートは300bpです。
何のインサートがですか?
NGS ペアエンドシークエンシング
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No.11460-1 - 2023/05/23 (火) 12:06:43 - ああ
NGSにおいて、150bpペアエンドシークエンシングがあるとおもいます。
ペアエンドシークエンシングの意味はわかるのですが、具体的にどこが150bpなのかわかりません。ちなみにインサートは300bpです。
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