Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

NGS ペアエンドシークエンシング トピック削除
No.11460-TOPIC - 2023/05/23 (火) 12:06:43 - ああ
NGSにおいて、150bpペアエンドシークエンシングがあるとおもいます。
ペアエンドシークエンシングの意味はわかるのですが、具体的にどこが150bpなのかわかりません。ちなみにインサートは300bpです。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



7件 ( 1 〜 7 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.11460-7 - 2023/05/23 (火) 16:29:18 - 774R
では、300bpの話を忘れて書きます。
単純に、リード長を150bpとしてシーケンスするという意味だと思います。それを両側から行う。

(無題) 削除/引用
No.11460-6 - 2023/05/23 (火) 16:25:05 - pp
アダプターの一番端にプライマーが結合して、インサートを150 basesまで読む、と理解しています。それが両側から読まれるので、例えば300 bpのインサートならば計算上、全長の配列が重複なく得られると。非専門家の雑な理解ですが。

(無題) 削除/引用
No.11460-5 - 2023/05/23 (火) 15:56:11 - ああ
関係ないですけど、念のため書いておきました。

(無題) 削除/引用
No.11460-4 - 2023/05/23 (火) 15:10:34 - 774R
そのインサート配列と、質問の最初に書かれていた150bpペアードシークエンシングとの関係は?

(無題) 削除/引用
No.11460-3 - 2023/05/23 (火) 13:10:45 - ああ
インサートサイズです。
アダプターを付加したインサート配列のことです。

(無題) 削除/引用
No.11460-2 - 2023/05/23 (火) 12:54:19 - 774R
>ちなみにインサートは300bpです。

何のインサートがですか?

NGS ペアエンドシークエンシング 削除/引用
No.11460-1 - 2023/05/23 (火) 12:06:43 - ああ
NGSにおいて、150bpペアエンドシークエンシングがあるとおもいます。
ペアエンドシークエンシングの意味はわかるのですが、具体的にどこが150bpなのかわかりません。ちなみにインサートは300bpです。

7件 ( 1 〜 7 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。