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ImageJ mergeしている部分の定量解析
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No.11408-TOPIC - 2023/04/27 (木) 07:06:09 -
KKK
いつもこの掲示板で勉強させていただいております。
ImageJの使い方で質問があります。培養細胞を用いてER内に共局在するたんぱくの輝度の定量を画像で行いたいと思っています。ERはER trackerで染色し、たんぱくは免疫染色で別の色に染色しており、2色使い分けているのですが、ER trackerで染色された部位に共局在するたんぱくの平均輝度を定量したいと思っています。ImageJでの操作方法をご存じの方は紹介いただければたいへん助かります。何卒よろしくお願いいたします。
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No.11408-6 - 2023/05/02 (火) 02:23:34 -
KKK
wwnさん
アドバイスをもとにmodifyすることで解析できました!
ありがとうございました!!
(無題)
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No.11408-5 - 2023/04/28 (金) 10:52:43 - wwn
基本機能でやる手順として思い浮かぶのは
1. ER trackerのチャンネルでマスク画像を作る
2. その画像をImageCalculatorで別のチャンネルの画像と掛け合わせる
3. 残った部分を計測
*散在すると思うので、手動ならROIManagerもしくはなにかpluginを使って
てなところでしょうか。
(無題)
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No.11408-4 - 2023/04/27 (木) 21:26:04 -
KKK
返信ありがとうございます。ご指摘のとおり無固定で生細胞を染色してます。
(無題)
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No.11408-3 - 2023/04/27 (木) 11:01:20 - qq
ERtrackerは、固定するなと書いてあるみたいだけど、タンパクの免疫染色は無固定なのかな?
(無題)
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No.11408-2 - 2023/04/27 (木) 09:52:00 - おお
ImageJはど素人だけど
ER trackerで染色したイメージを2階調にして目的のたんぱくを染色したイメージと重ね合わせると、ER trackerで染色した部分の目的のタンパクのシグナルだけを表示できそうだけどね。
ImageJ mergeしている部分の定量解析
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No.11408-1 - 2023/04/27 (木) 07:06:09 -
KKK
いつもこの掲示板で勉強させていただいております。
ImageJの使い方で質問があります。培養細胞を用いてER内に共局在するたんぱくの輝度の定量を画像で行いたいと思っています。ERはER trackerで染色し、たんぱくは免疫染色で別の色に染色しており、2色使い分けているのですが、ER trackerで染色された部位に共局在するたんぱくの平均輝度を定量したいと思っています。ImageJでの操作方法をご存じの方は紹介いただければたいへん助かります。何卒よろしくお願いいたします。
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