BioTechnicalフォーラム [転写因子の機能について]

転写因子の機能について

No.11405-TOPIC - 2023/04/26 (水) 09:47:51 - 転写因子

転写因子がターゲット遺伝子の転写を促進させることは常識であるが、一般的に転写因子がターゲットのプロモーターやエンハンサー領域に結合してる図がイラストとして描かれてるものが多いですよね？

そこで疑問に思ったのですが、転写因子がターゲットの配列にくっついてる時間はどれくらいなのでしょうか？もちろん水素結合の数によって大きく違ってくるかもしれませんが、大まかな知見をご教授頂けると幸いです。
　

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No.11405-9 - 2023/04/27 (木) 08:47:44 - ・・・

>[Re:8] G25さんは書きました :

ありがとうございます。
サプレッサー、勉強不足でした。

> レプレッサーは転写調節配列ではなく負に調節する転写因子（transcription factor)を指すんじゃないかな。

それは存じていますが、サイレンサーに結合するリプレッサー、という意味で使われたのかと勘違いしました。

(無題)

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No.11405-8 - 2023/04/26 (水) 20:16:28 - G25

転写を抑制あるいは負に調節する調節領域をtranscriptional suppressor elementまたはsuppressor element、あるいは単にsuppressorいう用法はあります。80~90年代くらいにはよく見かけて、genetic suppressor（表現型を抑制するsecond-site mutation）と紛らわしいなと思った記憶があるんですけど。
ざっと検索してみたらこれくらいしか見つけられなかった（ななめ読みなので誤読してたらご容赦）
ttps://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1128/mcb.12.10.4496-4502.1992
ttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15156193/
ttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23135915/

レプレッサーは転写調節配列ではなく負に調節する転写因子（transcription factor)を指すんじゃないかな。

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No.11405-6 - 2023/04/26 (水) 19:24:06 - ・・・

> 転写調節配列にサイレンサーとかサプレッサーというものがあって、

サプレッサーというのは聞いたことがない。リプレッサーのことかな？

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No.11405-5 - 2023/04/26 (水) 13:41:39 - おお

>[Re:3] Wさんは書きました :

> 専門ではないのでお聞きしたいのですが、抑制型転写因子は珍しい（非常識？）のでしょうか？

珍しいとは思わないのだけど、数的には活性化する因子の方が多いかなという印象はある。実際によく知られているものも多く、非常識というのは変だと思う。

(無題)

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No.11405-4 - 2023/04/26 (水) 12:33:40 - G25

転写調節配列にサイレンサーとかサプレッサーというものがあって、そういう配列に結合するのは抑制的転写調節因子だし、
bHLHやZF型の転写因子みたいに二量体を作る転写因子だと、同じ標的配列に結合しながら二量体のパートナーの違いで促進的に働いたり抑制的に働いたりするのがあるね。