Bio Technical フォーラム

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SeahorseによるミトコンドリアOCRの測定 トピック削除
No.11400-TOPIC - 2023/04/24 (月) 19:44:12 - 初心者
お世話になっております。
細胞外フラックスアナライザーXF HS Miniという機械を使用して、ミトコンドリア呼吸能を測定しようと思っています。そこで経験者の方に話を伺っていたところ、専用の8wellチャンバーで測定する際、端のwellは正確に測定できない(ことが多い)と言われました。

確かに蛍光ベースのアッセイのようなので、qPCR等と同じく光の反射?等の問題でそういうこともあるのかもしれないとも思いました。しかし、エッジ効果のメインは温度が原因だと思っていたので不思議な感じもします。

使用経験者の方、実際のところ結構値はブレますでしょうか?また、どなたか端のwellが測れない原因とその対策等が思いつく方がいらっしゃいましたらご教授ください。
 
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(無題) 削除/引用
No.11400-2 - 2023/04/25 (火) 10:11:03 - asan

というか、通常8wellの両端はベースラインの作成に使うと思うのでそもそもしようしないと思いますが。

できるかできないかで言えば、問題ない場合もありますが、wellなどの場合両端は空気乾燥しやすくメディウム量がぶれる原因にもなるので定量には不適というのがあります。seahourseの原理上メディウム量が変わると誤差が大きいです。

SeahorseによるミトコンドリアOCRの測定 削除/引用
No.11400-1 - 2023/04/24 (月) 19:44:12 - 初心者
お世話になっております。
細胞外フラックスアナライザーXF HS Miniという機械を使用して、ミトコンドリア呼吸能を測定しようと思っています。そこで経験者の方に話を伺っていたところ、専用の8wellチャンバーで測定する際、端のwellは正確に測定できない(ことが多い)と言われました。

確かに蛍光ベースのアッセイのようなので、qPCR等と同じく光の反射?等の問題でそういうこともあるのかもしれないとも思いました。しかし、エッジ効果のメインは温度が原因だと思っていたので不思議な感じもします。

使用経験者の方、実際のところ結構値はブレますでしょうか?また、どなたか端のwellが測れない原因とその対策等が思いつく方がいらっしゃいましたらご教授ください。

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