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(無題) 削除/引用 No.11373-2 - 2023/04/17 (月) 09:28:50 - WInter-8 >[Re:1] ぴーさんは書きました : > google colabo版のalphafold2を初めて使用しているのですが、5つの予測構造のうちどれを選択するか等の基準はあるのでしょうか。 rankがあります。 ファイルをダウンロードすると、proteinname_XXXX_unrelaxed_rank_1_model_2.pdbのような名前になっていると思います。rank_1が最もスコアが高い構造です。 > また一般的な3次元構造予測の際に使用するのは、AlphaFold2_mmseqs2が良いのでしょうか。 OKです。mmseq2とadvancedがありますが、大きな違いはありません。mmseq2の方が複合体構造の予測には良いようです。 AlphaFold2については、日本語の総説も出ています。一般向け（計算科学や構造解析が専門でない人）の総説もウェブ上にあるので、探してみてください。

タンパク質の3次元構造予測について 削除/引用 No.11373-1 - 2023/04/17 (月) 00:13:32 - ぴー google colabo版のalphafold2を初めて使用しているのですが、5つの予測構造のうちどれを選択するか等の基準はあるのでしょうか。 また一般的な3次元構造予測の際に使用するのは、AlphaFold2_mmseqs2が良いのでしょうか。 素人質問で申し訳ないのですが、ご教授お願い致します。

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