Bio Technical フォーラム

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細胞の径を調べるためのgating方法 トピック削除
No.11364-TOPIC - 2023/04/13 (木) 10:49:16 - NNT
ある遺伝子の機能を浮遊性細胞を使って調べています。

過去の研究から、その遺伝子の器質タンパク質は、細胞の大きさを変化させることが分かっているので、RNAi前後で同様に細胞径を比較したいと思っています。

浮遊性細胞の径を、フローサイトメトリーのFSCで算出する予定ですが、かなりdebrisも混在しているため、それを除いた上で、算出したいと思っています。

がしかし、debrisを除こうと思うと、今度は、FSCのgatingでバイアスがかかってしまうのですが、こういうケースはどうやってgatingをするのがいいのでしょうか。

もちろん、直接の顕微鏡観察も重要なのですが、結構差違は小さいので、正確に算出しようと思うと、FSCの方がベターな気がします。
 
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(無題) 削除/引用
No.11364-2 - 2023/04/14 (金) 09:42:43 - Tracker
核染色やらでまず生細胞集団をゲートしてdebrisと分離すれば良いのでは?

細胞の径を調べるためのgating方法 削除/引用
No.11364-1 - 2023/04/13 (木) 10:49:16 - NNT
ある遺伝子の機能を浮遊性細胞を使って調べています。

過去の研究から、その遺伝子の器質タンパク質は、細胞の大きさを変化させることが分かっているので、RNAi前後で同様に細胞径を比較したいと思っています。

浮遊性細胞の径を、フローサイトメトリーのFSCで算出する予定ですが、かなりdebrisも混在しているため、それを除いた上で、算出したいと思っています。

がしかし、debrisを除こうと思うと、今度は、FSCのgatingでバイアスがかかってしまうのですが、こういうケースはどうやってgatingをするのがいいのでしょうか。

もちろん、直接の顕微鏡観察も重要なのですが、結構差違は小さいので、正確に算出しようと思うと、FSCの方がベターな気がします。

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