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薬剤処理による表現型 トピック削除
No.11358-TOPIC - 2023/04/11 (火) 22:36:18 - DAN
ある臨床検体で見つけてきた遺伝子変異の研究をしています。

とある生体内には存在しない薬剤を投与したところ、表現型の差が出たのですが、残念なことに、変異だけでは表現型がはっきりしません。生体内に存在する薬剤では表現型の差は出ません。さらに臨床検体で変異ありなしに分けて解析しても、その表現型の差は統計学的にははっきりしません。

この場合、変異の意義をどう説明するのが正しいのでしょうか。
 
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(無題) 削除/引用
No.11358-4 - 2023/04/12 (水) 02:21:58 - おお
まあいろんな論文を読んでください。

そのpathwayはあなたの注目する病理、生理的現象にどうかかわっているのですか?あるいはかかわりがありそうだという仮説のもとに研究を進めることもできる。もちろん、そういう意義がわからなくても報告には値します。実はその後の研究で重要なことだとわかることもあるのですから、その場合はあなたは第一発見者です。


>これはどういう意味ですか?

従来の活性がなくなるとか、変異がある位置がたんぱく等の相互作用に関係してたら結合がなくなるとか強くなるとか、弱くなるとか。局在が変わるとか、安定性が変わるとか、また見かけ上アミノ酸が変化するように見えても、mRNAのメタボリズムが変わって発現してないとか、、、、

(無題) 削除/引用
No.11358-3 - 2023/04/12 (水) 02:03:50 - DAN
実は、その薬剤は、あるタンパク質を阻害することが分かっています。

ですので、そのpathwayが関わることは間違いなさそうです。

こういう研究は、結果を淡々と書いて、このpathwayに関係があると記載すれば、十分なのでしょうか。臨床形態で、明らかな差が見られないので、本当に生体で意義があるのか、問題になりそうですが。。。



>その変異によってできる遺伝子産物のCharacterizeも考えてみてはどうかと思いますし。

これはどういう意味ですか?点突然変異で、アミノ酸が一個だけ変わります。

(無題) 削除/引用
No.11358-2 - 2023/04/12 (水) 01:13:18 - おお
>とある生体内には存在しない薬剤を投与したところ、表現型の差が出たのですが、

そこを突き詰めれば何らかの変異体の情報が得られるのではないですか?
その変異によってできる遺伝子産物のCharacterizeも考えてみてはどうかと思いますし。

そもそも細胞の実験に使う薬剤とか生体に存在しないもの(少なくとも使っている細胞の種(ヒトとかマウスとか)にないもの)を使うわけですし。

生体にあるものと同じたぐいのものであればKdとか局所への移行とかなど微妙な違いが結果に表れている可能性もあるでしょうし。

薬剤処理による表現型 削除/引用
No.11358-1 - 2023/04/11 (火) 22:36:18 - DAN
ある臨床検体で見つけてきた遺伝子変異の研究をしています。

とある生体内には存在しない薬剤を投与したところ、表現型の差が出たのですが、残念なことに、変異だけでは表現型がはっきりしません。生体内に存在する薬剤では表現型の差は出ません。さらに臨床検体で変異ありなしに分けて解析しても、その表現型の差は統計学的にははっきりしません。

この場合、変異の意義をどう説明するのが正しいのでしょうか。

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