Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

生存期間解析で2群化する際のカットオフの決め方 トピック削除
No.11306-TOPIC - 2023/03/28 (火) 07:27:07 - ROC
統計初心者です。よろしくお願いします。

20例の患者サンプルで、バイオマーカーA(連続変数)を測定しました。全例で生存期間データが得られています。このデータを用い、Aの値でサンプルを2群に分け、カプランマイヤー・ログランクで生存曲線の有意差の有無を調べるよう指示されてます。2群に分けるのにROC解析を使うよう言われているのですが、要領を得ません。つまづいているポイントは、

1. 通常のROCはアウトカム(従属変数)が2分変数である事が条件と理解してますが、イベント発生と打ち切りを含めた生存期間からなるアウトカムを2分変数に変換する方法が分かりません。

2. 時間依存性ROC解析というのがあるようで、risksetROC、timeROCなどと呼ばれるパッケージがRにあるようなのですが、これらは生存期間データをそのままROC解析するためのパッケージと理解して良いでしょうか?

3. そもそもカットオフ値を動かして最適な条件を見出すというROCのプロセスが、統計学的に正しいのかよく分かりません。最小P値法に似てる気がして不安です。

不勉強で申し訳ありませんが、ご指導いただけると幸いです。よろしくお願いします。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



1件 ( 1 〜 1 )  前 | 次  1/ 1. /1


生存期間解析で2群化する際のカットオフの決め方 削除/引用
No.11306-1 - 2023/03/28 (火) 07:27:07 - ROC
統計初心者です。よろしくお願いします。

20例の患者サンプルで、バイオマーカーA(連続変数)を測定しました。全例で生存期間データが得られています。このデータを用い、Aの値でサンプルを2群に分け、カプランマイヤー・ログランクで生存曲線の有意差の有無を調べるよう指示されてます。2群に分けるのにROC解析を使うよう言われているのですが、要領を得ません。つまづいているポイントは、

1. 通常のROCはアウトカム(従属変数)が2分変数である事が条件と理解してますが、イベント発生と打ち切りを含めた生存期間からなるアウトカムを2分変数に変換する方法が分かりません。

2. 時間依存性ROC解析というのがあるようで、risksetROC、timeROCなどと呼ばれるパッケージがRにあるようなのですが、これらは生存期間データをそのままROC解析するためのパッケージと理解して良いでしょうか?

3. そもそもカットオフ値を動かして最適な条件を見出すというROCのプロセスが、統計学的に正しいのかよく分かりません。最小P値法に似てる気がして不安です。

不勉強で申し訳ありませんが、ご指導いただけると幸いです。よろしくお願いします。

1件 ( 1 〜 1 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。