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TPMでのグラフ作成と統計処理 トピック削除
No.11246-TOPIC - 2023/03/05 (日) 16:10:07 - マウス
公共のデータに登録されたデータを再解析しています。
ある遺伝子について、健常者と、サンプルの入手が難しい疾患で比較をしました。

最近では多検体でのRNAseqの結果をTPMで表記しているものをよく見ますが、この場合は統計処理はできるものなのでしょうか？

統計処理ができるなら、TPMの値で検定した結果なのか、それとも全遺伝子で検定した場合の値（この場合はFDRや補正p値）を使うのが良いのでしょうか？

よろしくお願いします。
　
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TPMでのグラフ作成と統計処理 削除/引用
No.11246-1 - 2023/03/05 (日) 16:10:07 - マウス
公共のデータに登録されたデータを再解析しています。
ある遺伝子について、健常者と、サンプルの入手が難しい疾患で比較をしました。

最近では多検体でのRNAseqの結果をTPMで表記しているものをよく見ますが、この場合は統計処理はできるものなのでしょうか？

統計処理ができるなら、TPMの値で検定した結果なのか、それとも全遺伝子で検定した場合の値（この場合はFDRや補正p値）を使うのが良いのでしょうか？

よろしくお願いします。
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