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myc活性の評価方法
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No.11219-TOPIC - 2023/02/17 (金) 16:11:55 - 初学者
細胞株にある遺伝子変異を導入したところ、RNA-seqによるGSEAにおいて、Myc targetの遺伝子群の発現が減弱するという結果を得ました。
そこでMycの活性が実際にどうなっているかを評価したいのですが、どのようなアッセイを行えばよいでしょうか?
簡単に思いつくのはウエスタンでMycの発現をみることかと思うのですが、他に何かあれば教えてもらえると助かります。
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No.11219-4 - 2023/02/18 (土) 15:49:46 - 2ME
マイクロプレート・キャプチャーアッセイもある。多検体処理向き。
キット例、
https://www.activemotif.jp/catalog/188/transam-c-myc
自作してもよい。
あとはBiacoreなどSPR。
(無題)
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No.11219-3 - 2023/02/18 (土) 11:57:34 - おお
Chipアッセイもありかもね。
(無題)
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No.11219-2 - 2023/02/17 (金) 17:38:16 - おお
Mycが結合っして下流のルシフェラーぜの転写が促進されるような、Reporterを使うのまずは思いつきますが。
あるいは細胞の核からタンパクを抽出して、myc認識配列を使いゲルシフトアッセイするとか。
myc活性の評価方法
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No.11219-1 - 2023/02/17 (金) 16:11:55 - 初学者
細胞株にある遺伝子変異を導入したところ、RNA-seqによるGSEAにおいて、Myc targetの遺伝子群の発現が減弱するという結果を得ました。
そこでMycの活性が実際にどうなっているかを評価したいのですが、どのようなアッセイを行えばよいでしょうか?
簡単に思いつくのはウエスタンでMycの発現をみることかと思うのですが、他に何かあれば教えてもらえると助かります。
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