Bio Technical フォーラム

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shRNAの核酸供与体 トピック削除
No.11164-TOPIC - 2023/02/01 (水) 20:05:42 - AAA
いつも勉強させてもらっています。
shRNAの鋳型配列DNAを搭載したplasmid DNAを動物に接種するための遺伝子組換実験計画書を記載しています。
このshRNAの鋳型配列の「核酸供与体」をなんと書くべきが迷っています。
今回shRNAが標的にするはヒトのAkt1 mRNAなのですが、shRNAの鋳型の配列はmRNAと相補的な配列として設計されたものなので、何かの由来?というよりは完全な人工配列と言っていいのではないかと思います。
すると核酸供与体は「なし」、供与核酸は「Akt1 shRNA(合成DNA)」となるのではないかと思いますが、考え方として合っていますか?
遺伝子組換実験計画書は、言葉の使い方というか、用語が示す概念が少々複雑でいつも迷います。
 
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(無題) 削除/引用
No.11164-3 - 2023/02/06 (月) 13:07:56 - AAA
情報ご教示いただきありがとうございます!
調べてみました。
ttps://www.lifescience.mext.go.jp/bioethics/data/anzen/position_09.pdf
こちらですね。
「このような遺伝子組換えウイルス等の供与核酸から産生されるsiRNA等が、当該ウイルス等が感染する生物の細胞内において特定の遺伝子の発現に影
響を与えるように設計されている場合には、それらが相補性を有するものと考え、当該生物を核酸供与体と見なすことが可能である。」

今回、ヒトの細胞での遺伝子発現を抑制するためのshRNAを設計していますので、核酸供与体は「ヒト(クラス1)」ということで記載しようと思います。

(無題) 削除/引用
No.11164-2 - 2023/02/02 (木) 22:46:20 - shRNA
ヒト遺伝子をノックダウンするshRNAなら核酸供与体はヒトみたいですね。
マウスにもヒトにも相補ならどちらでもいいということでしょうかね。

ライフサイエンスの広場に平成16年のポジションペーパー載ってますよ。

shRNAの核酸供与体 削除/引用
No.11164-1 - 2023/02/01 (水) 20:05:42 - AAA
いつも勉強させてもらっています。
shRNAの鋳型配列DNAを搭載したplasmid DNAを動物に接種するための遺伝子組換実験計画書を記載しています。
このshRNAの鋳型配列の「核酸供与体」をなんと書くべきが迷っています。
今回shRNAが標的にするはヒトのAkt1 mRNAなのですが、shRNAの鋳型の配列はmRNAと相補的な配列として設計されたものなので、何かの由来?というよりは完全な人工配列と言っていいのではないかと思います。
すると核酸供与体は「なし」、供与核酸は「Akt1 shRNA(合成DNA)」となるのではないかと思いますが、考え方として合っていますか?
遺伝子組換実験計画書は、言葉の使い方というか、用語が示す概念が少々複雑でいつも迷います。

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