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RNA-seqとGene chip dataの違い トピック削除
No.11146-TOPIC - 2023/01/27 (金) 15:19:48 - s
パブリックデータの解釈の質問です。
RNA-seqはmRNAを網羅的に調べているのはわかるのですが、
Gene chipはどのような認識と考えるべきでしょうか？
両者ともどの遺伝子も検索可能で、各々によって遺伝子によっては結果が異なることがあるのですが、どのように解釈してよいのか判断しかねております。
（ex 遺伝子AはRNA-seqでは正常部において対照群より高いが、Gene chipでは低い）
　
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(無題) 削除/引用
No.11146-6 - 2023/01/28 (土) 13:32:33 - s
ありがとうございます。

(無題) 削除/引用
No.11146-5 - 2023/01/28 (土) 12:58:25 - おお
microarray
hybridization

(無題) 削除/引用
No.11146-4 - 2023/01/28 (土) 12:15:16 - 774R
ggrks

(無題) 削除/引用
No.11146-3 - 2023/01/28 (土) 11:36:26 - s
おお様

ご返事ありがとうございます。
Gene chipも網羅的なのですね。
大まかにどのような方法なのでしょうか？

(無題) 削除/引用
No.11146-2 - 2023/01/27 (金) 15:46:09 - おお
Gene chipも網羅的です。
検出方法が違うので、エラー(アーティファクト)ので方も異なります。どちらも100%正しい保証はありません。

RNA-seqとGene chip dataの違い 削除/引用
No.11146-1 - 2023/01/27 (金) 15:19:48 - s
パブリックデータの解釈の質問です。
RNA-seqはmRNAを網羅的に調べているのはわかるのですが、
Gene chipはどのような認識と考えるべきでしょうか？
両者ともどの遺伝子も検索可能で、各々によって遺伝子によっては結果が異なることがあるのですが、どのように解釈してよいのか判断しかねております。
（ex 遺伝子AはRNA-seqでは正常部において対照群より高いが、Gene chipでは低い）
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