Bio Technical フォーラム

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RNA immunoprecipitationは間接的な結合にも使うには、 トピック削除
No.11141-TOPIC - 2023/01/25 (水) 16:02:31 - Exosome
様々なスプライシングに関わる因子にがっつりと結合するタンパク質を同定しました。RNA immunoprecipitationでどの遺伝子がターゲットなのか、RNA-seqで調べたいと考えています

しかし問題点としてこのタンパク質自体は、RNAには結合しません。自分が調べた感じですと、間接的な結合にもRNA IPは適用可能にも思えますが、過去に似たような状況で経験のある方いらっしゃいますか。

市販キットが使用かもお聞きしたいのですが、、、
　
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(無題) 削除/引用
No.11141-2 - 2023/01/25 (水) 23:40:23 - おお
端的に言うとできます。この手のプロトコールの中には、直接的な結合を優先するためくふうしているプロトコールもありますので、時間があれば突っ込んだコメントだできるかもしれません。

RNA immunoprecipitationは間接的な結合にも使うには、 削除/引用
No.11141-1 - 2023/01/25 (水) 16:02:31 - Exosome
様々なスプライシングに関わる因子にがっつりと結合するタンパク質を同定しました。RNA immunoprecipitationでどの遺伝子がターゲットなのか、RNA-seqで調べたいと考えています

しかし問題点としてこのタンパク質自体は、RNAには結合しません。自分が調べた感じですと、間接的な結合にもRNA IPは適用可能にも思えますが、過去に似たような状況で経験のある方いらっしゃいますか。

市販キットが使用かもお聞きしたいのですが、、、
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