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NGS解析(iDEP.96の使い方) 削除/引用 No.11117-1 - 2023/01/16 (月) 18:37:39 - T.K. いつも勉強させていただいております。 現在私は、コントロール群と疾患モデル群でそれぞれNGSデータを取得し、iDEP.96というサイトを用いて解析を行っております。 GO解析やpathway解析は問題なく行えております。 解析としてはここまででもとりあえず十分なのですが、DEG2のタブの「Enrichment analysis for DEGs」の欄にある「Drug.CTD」や「Drug.Drug.Perturbatios.from.GEO.down」といった項目が気になっております。ただ、試してみたところ結果の見方がよくわかりませんでした。 疾患モデル群での遺伝子発現の変動と逆に変動させる（例えば疾患で発現量が増加している遺伝子群の発現量を減少させる）ような薬剤候補が探索できればありがたいのですが、上記の項目はこのような探索に使えるものなのでしょうか？ もしくはこのような探索を行えるツール等はありますでしょうか？ NGS初心者なため的外れな質問かもしれませんが、よろしくお願いいたします。

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