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0.25xTBE/TAE トピック削除
No.11064-TOPIC - 2022/12/23 (金) 05:58:15 - おお
最近ちちらっと0.25xの濃度でTAEやTBEを使った核酸の電気泳動(PAGEやアガロース)を見かけました。
実践されている方いますか?
電流が抑えられるので電圧が高く設定できて速いというメリットがありますが、感触など持っている方いますでしょうか。
 
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No.11064-6 - 2022/12/23 (金) 09:54:53 - G25
普段からアガロースゲル電気泳動は0.5xTAEを使っています。

かつてあったMupidのあるバージョン(i-Mupid.Jだか)は0.5xが指定されていて、1xを使うと回路が加熱して途中で止まったりして調子が悪くなった。それからの名残で0.5xを使い続けているのと、
同じストック溶液(50x)を使うにしても1xと0.5xじゃ二倍も使えますから、お得(費用は微々たるものだけど、ストック溶液を調製する頻度、試薬を注文する頻度が下がるのがうれしい)。

蛇足ですが、
ルーチンの泳動ではいちいちバッファーを交換せずに使い回すことが多いと思います。蒸発して減った分をバッファーで注ぎ足すとだんだんイオン強度が高くなって、しまいにゃ過電流でフューズが切れます。普段からバッファーの水面の高さを決めておいて、脱イオン水を注ぎ足すようにしています。

0.5xだとたまたま蒸発で濃度が高くなってもフューズが切れるまではなかなかいかないという点でも安全かも。

(無題) 削除/引用
No.11064-5 - 2022/12/23 (金) 09:50:30 - おお
>[Re:4] nonameさんは書きました :
> パルスフィールドとかをやるときは0.5x TBEが基本だったと思います。
> 私もPCR断片などの電気泳動を早く終わらせたいときはTAEなどは薄めで作ったりします。
> バッファーが熱くなりやすいのでそれだけは気を付けて。


個人的には0.5xをDNAの長さのチェックなどではよく使います。フレキシブルにやっているのですね。

(無題) 削除/引用
No.11064-4 - 2022/12/23 (金) 09:08:34 - noname
パルスフィールドとかをやるときは0.5x TBEが基本だったと思います。
私もPCR断片などの電気泳動を早く終わらせたいときはTAEなどは薄めで作ったりします。
バッファーが熱くなりやすいのでそれだけは気を付けて。

(無題) 削除/引用
No.11064-3 - 2022/12/23 (金) 08:31:14 - おお
>[Re:2] 杏里さんは書きました :
> 薄めて使うことありますよ。
> ゲルシフトアッセイする際のバッファーは低塩濃度にして電流をおさえて
> 複合体が解離しないようにします。

なるほど、複合体のアッセイとかにはもってこいかも知れません。

通常のDNA断片のサイズを見るような場合も薄めたりしますか?

(無題) 削除/引用
No.11064-2 - 2022/12/23 (金) 07:20:26 - 杏里
薄めて使うことありますよ。
ゲルシフトアッセイする際のバッファーは低塩濃度にして電流をおさえて
複合体が解離しないようにします。

0.25xTBE/TAE 削除/引用
No.11064-1 - 2022/12/23 (金) 05:58:15 - おお
最近ちちらっと0.25xの濃度でTAEやTBEを使った核酸の電気泳動(PAGEやアガロース)を見かけました。
実践されている方いますか?
電流が抑えられるので電圧が高く設定できて速いというメリットがありますが、感触など持っている方いますでしょうか。

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