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プラークアッセイについて トピック削除
No.11017-TOPIC - 2022/12/06 (火) 11:26:03 - おまめ
プラークアッセイ法では寒天を重層しているのですが、下層寒天培地の役割がわかりません。上層である寒天培地にはファージ、宿主、宿主の餌となる軟寒天があるため単層でも可能ではないかと考えています。
初歩的な質問になってしまうのですが、下層寒天培地の役割を教えていただきたいです。よろしくお願いいたします。
 
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No.11017-6 - 2022/12/08 (木) 10:54:23 - おまめ
軟寒天のみで作成した際はそこまで厚みをもたせていなかったため、momoさんが仰る通り栄養不足だったのかもしれないです。
上層に厚みを持たせると見えずらくなるというのも一度行ったことがあるため理解できます。
お二人の意見から下層寒天は宿主菌の栄養という役割が大きいのかもしれないですね。
個人の興味のために沢山回答いただきありがとうございました。

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No.11017-5 - 2022/12/07 (水) 23:45:55 - おお
ソフトアガーの容量ってそんなに多くないでしょうから、それだけをプレートに撒いた状態だと感想も速いだろうし。かと言って容量を上げると分厚くなり、その中の一点からファージが広がっていくのだから、上部、下部まで到達出来ず、プレートを上から見た時全体が曇って見えて、プラークを見にくいと思う。
また、アガープレートとの方に抗生物質や、x-galなど含ませている事もある。

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No.11017-4 - 2022/12/07 (水) 16:54:30 - momo
大腸菌が活発に増えるためには十分な酸素供給が必要なので、プレートの奥深くだとそれが難しいかなと思いました。

上層だけ、というのは軟寒天で十分な厚さを作ったということか、下層の寒天培地なしに薄い軟寒天の層だけを使ったということかのどちらでしょうか。後者であればもちろん栄養が不足しているということだと思います。

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No.11017-3 - 2022/12/07 (水) 12:43:21 - おまめ
ご回答いただきありがとうございます。


プラークアッセイには厚みが重要だと考えていらっしゃるのですね。
一度、上層だけで作成したことがあり、その際は宿主となる菌が重層した場合に比べてあまり増殖しませんでした。

また、「プレート内部のエアレーションも問題になるかもしれない」
こちらについてもう少し詳細に考えをお聞かせいただければ幸いです。

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No.11017-2 - 2022/12/06 (火) 14:57:20 - momo
考えたこともなかったので思いつきを書きますが、

・増殖中のファージが二次元的に広がった方が、厚みのある寒天内部で広がるよりプラークを識別しやすい
・プレート内部のエアレーションも問題になるかもしれない
・そもそも軟寒天であの厚さが維持できるでしょうか

プラークアッセイについて 削除/引用
No.11017-1 - 2022/12/06 (火) 11:26:03 - おまめ
プラークアッセイ法では寒天を重層しているのですが、下層寒天培地の役割がわかりません。上層である寒天培地にはファージ、宿主、宿主の餌となる軟寒天があるため単層でも可能ではないかと考えています。
初歩的な質問になってしまうのですが、下層寒天培地の役割を教えていただきたいです。よろしくお願いいたします。

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