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(無題) 削除/引用 No.11006-3 - 2022/12/02 (金) 19:17:49 - asan 基本的には関係ありません。 ORF(CDS)であればいいですし、ゆえにsiRNAで意図的に3'UTRをターゲットする場合もあります。 ただ、当然バリアント特異的なexonを選んだらものによっては別の影響を反映する可能性があります。

(無題) 削除/引用 No.11006-2 - 2022/12/02 (金) 05:25:17 - おお 論文とか探さないの？ mRNAはCapとPoly Aによって安定化してますから切ると片方しか持っておらず安定性が保てません。ですからあまり位置に拘る必要はないと思いますが、ターゲットの配列を含まないmRNAなどが同じGene locusから発現している場合はそういうものを検出してしまう可能性があります（そこまで考えてデザインしている人がいるかどうかわかりませんが）。切れるという活性を見るという視点での研究であれば認識部位をまたぐ方が直接的ではあります。 また、その他の懸念としてはsiRNAとmiRNAのパスは酷似していますからmiRNA的な活性がドミナントになればTranslationの阻害が起こるけどRNAは分解されないという可能性があります。そういう意味ではタンパクを見たほうがスッキリします。

RNAiの効果を実証するためのqPCRプライマー 削除/引用 No.11006-1 - 2022/12/02 (金) 05:07:34 - DNA RNAiの効果を実証するためのqPCRプライマーを作成する予定です。 はっきりと効果を確認するためには、siRNAがかかっている箇所を挟むべきでしょうか。

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