塩基配列も品質スコアもテキストとして開くだけなら、text editorならなんでもいい。ただし、巨大なmultiple Fastqファイルなんかを開くなら、大きなサイズのファイルを扱うのに優れたソフトを選んだほうがいい。Windowsのワードパッドやメモ帳は扱うことのできるファイルサイズが小さい。
塩基配列だけ抜き出して、各塩基ごとに品質スコアをヒストグラムで並列表示するのには、私はSnapGene Viewer (SnapGeneの無料版)を使っています。multiple Fastqも読み込んで、個々のエントリーごとに切り分けてくれます。 |
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