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遺伝子組換え体の表記法 トピック削除
No.10962-TOPIC - 2022/11/16 (水) 13:25:47 - B4
初歩的な質問で申し訳ないのですが、遺伝子操作を行った変異株の表記でtg[ubi::sfGFP-zf bncr]などとあるのですが、どういった操作がされているのでしょうか?表記ルールなどありましたらおしえていただきたいです。
 
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No.10962-4 - 2022/11/17 (木) 16:18:31 - G25
bncr遺伝子のzinc finger domainということかしら(zfはzinc fingerの省略としてよく使われる)。
http://zfin.org/ZDB-GENE-180907-1

先の書き込みは公式なnomenclatureを前提のコメントだったのですが、
得てして、論文などでの記載は公式なルールに従っていなくて著者独自の命名だったりするので注意。公式ルールだと思いこんでいると混乱することもあります。表記だけで判断せずに原著論文でどういうものかを確認することも必要です。

(無題) 削除/引用
No.10962-3 - 2022/11/17 (木) 15:57:20 - 名無し
基本的には、ユビキチンプロモーターとsfGFPをつなげた融合遺伝子の過剰発現株だと思います。
-zf bncrは何のことかわかりません。

G25さんのおっしゃるように各生物種ごとにルールがあったりするので、詳しくは教官なり先輩なりに聞いてください。

(無題) 削除/引用
No.10962-2 - 2022/11/16 (水) 14:21:33 - G25
生物種ごとに異なるルールや慣習があります。
なので生物種を特定しないと答えられない。

一番いいのは、各生物種のゲノムプロジェクトのサイトなどに行ってgenetic nomenclatureのガイドラインを読むこと。あるいはストックセンターなど(マウスだったらJackson labとか)の遺伝子型、系統名の記載法の解説を見てみること。

遺伝子組換え体の表記法 削除/引用
No.10962-1 - 2022/11/16 (水) 13:25:47 - B4
初歩的な質問で申し訳ないのですが、遺伝子操作を行った変異株の表記でtg[ubi::sfGFP-zf bncr]などとあるのですが、どういった操作がされているのでしょうか?表記ルールなどありましたらおしえていただきたいです。

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