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SNPジェノタイピング解析結果の解釈について トピック削除
No.10926-TOPIC - 2022/11/02 (水) 15:48:47 - おお
SNPジェノタイピング解析結果の解釈について。
がん細胞株のDNAを用いてデータ取得した際、コピー数の3倍以上の増加もしくは2倍以上の減少がみられた際には「異常あり」と判断しています。
ラボで昔からそういうことになっているからという感じの理由なのですが、根拠となる文献等、はっきりしておりません。コピー数変化の閾値設定について、なにか根拠をご存知の方いらしゃればご教示いただけますでしょうか。
 
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No.10926-5 - 2022/11/14 (月) 11:34:38 - おお
>ああ様
何か根拠となる論文があるらしく、それを探しているのですが見つからないのです。

(無題) 削除/引用
No.10926-4 - 2022/11/14 (月) 11:31:49 - おお
>おお様
お名前重複してしまい申し訳ございません。
次回から変更いたします。
その基準の根拠が知りたいと思い質問させていただいた次第です。

(無題) 削除/引用
No.10926-3 - 2022/11/03 (木) 02:23:12 - ああ
昔からしかし根拠がわからないということなので、根拠を考察せずにルーチンになってしまった研究員がはびこってしまったとすると.....

別のSNP試験での結果の際に、ガン検査の結果と一致したのが、3倍くらいだった。ひとまず当初はそれを基準に別の研究を行っていた。そのまま根拠は忘れ去られ数字だけが残ったとかではないでしょうか?

(無題) 削除/引用
No.10926-2 - 2022/11/03 (木) 01:46:46 - おお

>コピー数の3倍以上の増加もしくは2倍以上の減少がみられた際には

むかしからいる「おお」です。


そのコピー数の基準はなんでしょう。

SNPジェノタイピング解析結果の解釈について 削除/引用
No.10926-1 - 2022/11/02 (水) 15:48:47 - おお
SNPジェノタイピング解析結果の解釈について。
がん細胞株のDNAを用いてデータ取得した際、コピー数の3倍以上の増加もしくは2倍以上の減少がみられた際には「異常あり」と判断しています。
ラボで昔からそういうことになっているからという感じの理由なのですが、根拠となる文献等、はっきりしておりません。コピー数変化の閾値設定について、なにか根拠をご存知の方いらしゃればご教示いただけますでしょうか。

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