分解にRNaseが係わる場合は、RNaseの種類によるでしょう。
RNase protection assay はご存知じ?
一本鎖特異的RNaseがRNA:DNA二重鎖部分のRNAを分解できないことを利用しています。そこで使われるRNaseはRNA除去にも使われるかのRNase Aなんですから、ハイブリッドになった時の分解されにくさがわかるというもの。
ご存知のように、cDNA合成後のRNA:cDNAハイブリッドのRNAを分解するのには二重鎖を成しているRNA特異的ないRNase Hを使います。
非酵素液な分解でも、二重鎖になると、2‘-OHがリン酸ジエステル結合を吸核攻撃する立体構造上の自由度が制限されると思うので、やはり分解しにくくなっていると思います。 |
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