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codon optimize について
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No.10877-TOPIC - 2022/10/16 (日) 22:21:10 -
ps
CRSPRで培養細胞で遺伝子Aをノックアウトしようとかんがえています。この培養細胞には内在性の遺伝子Aの他に、レンチウイルスで導入した遺伝子Aもあります。その際、内在性の遺伝子Aのみをノックアウトしたいので、レンチウイルスで導入する遺伝子Aにcodon optimizeを行おうと思います。このとき、@gRNAのターゲット配列を変える、APAM配列をつぶす のはどちらがベターでしょうか?
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No.10877-2 - 2022/10/18 (火) 01:56:23 - おお
何も情報がない私の個人的な印象でいうと、ターゲットの配列を認識できないならそれ以降の反応が起きないわけだしそっちのほうが安心かなと思う。ただコドンをいじるだけでどれくらい相同性を下げれるか気になるところではあるので、両方潰せないのかと思ったりもする。
codon optimize について
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No.10877-1 - 2022/10/16 (日) 22:21:10 -
ps
CRSPRで培養細胞で遺伝子Aをノックアウトしようとかんがえています。この培養細胞には内在性の遺伝子Aの他に、レンチウイルスで導入した遺伝子Aもあります。その際、内在性の遺伝子Aのみをノックアウトしたいので、レンチウイルスで導入する遺伝子Aにcodon optimizeを行おうと思います。このとき、@gRNAのターゲット配列を変える、APAM配列をつぶす のはどちらがベターでしょうか?
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