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過剰発現の基準をFlow cytometryで表現するには。 トピック削除
No.10873-TOPIC - 2022/10/15 (土) 00:03:55 - ADA
RFP融合タンパク質を強制発現させ、発現後に、空ベクターとの比較で、RFPの強度をFACSで調べました。

ピーク自体は数倍程度シフトしているのは間違いないのですが、面積としては、オーバーラップが大きく、histogramで空ベクターでの発現が1%未満になる領域を設定・比較すると10%ほどにしかなりません。

図自の方法としては、median等にするべきでしょうか。

また、強制発現にしては弱い気もするのですが、妥当なのでしょうか。。。顕微鏡上は大きな差にも思えましたが、今考えると、おそらく蛍光が弱い細胞が一定数いて、強制発現系として妥当なのか、今更悩んでいます。
　
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過剰発現の基準をFlow cytometryで表現するには。 削除/引用
No.10873-1 - 2022/10/15 (土) 00:03:55 - ADA
RFP融合タンパク質を強制発現させ、発現後に、空ベクターとの比較で、RFPの強度をFACSで調べました。

ピーク自体は数倍程度シフトしているのは間違いないのですが、面積としては、オーバーラップが大きく、histogramで空ベクターでの発現が1%未満になる領域を設定・比較すると10%ほどにしかなりません。

図自の方法としては、median等にするべきでしょうか。

また、強制発現にしては弱い気もするのですが、妥当なのでしょうか。。。顕微鏡上は大きな差にも思えましたが、今考えると、おそらく蛍光が弱い細胞が一定数いて、強制発現系として妥当なのか、今更悩んでいます。
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