Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

Flagタグ融合タンパク質を強発現している細胞の選別 トピック削除
No.10852-TOPIC - 2022/10/08 (土) 01:19:50 - JSS
ウイルスを使って、Flagタグ融合タンパク質のpolyclonalな安定株を作成しました。

特定の1細胞を解析するとバイアスがかかる可能性があるため、polyclonalな状態を維持したままで、Flag融合タンパク質を強発現している細胞を選別したいと考えています。

細胞質に存在するタンパク質を導入しているのですが、Flow等で、分画化することは可能でしょうか?

あるいは何か他にいいアイデアはありますでしょうか。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



3件 ( 1 〜 3 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.10852-3 - 2022/10/08 (土) 01:48:55 - おお
>もう一つのやり方はそのFLAGTagたんぱく導入のときに薬剤耐性マーカーを使っているでしょうから、導入株を作ったときの薬剤の濃度より高い濃度にさらしてしばらく培養して低発現の細胞を除く。ただどこまでうまくいくかわかりませんので、もう一度FLAGTagたんぱく導入をして、より高い薬剤濃度で選択するほうがベターかも。

まてよ、ウイルス(レトロとかレンチなら)その細胞株に更に感染してMOIを上げる事もできそうだね。

(無題) 削除/引用
No.10852-2 - 2022/10/08 (土) 01:46:20 - おお
>Flow等で、分画化することは可能でしょうか?
蛍光などがないと私には分離できる方法論を思いつきません。染めるには固定しないと多分無理だろうし(よほど今まで殆どやられてない方法論を樹立してやるならべつですが、たとえばFLAGにつくと蛍光活性がでる小分子やたんぱくなど)。

それとも蛍光などなしに何らかの特徴でピックアップすることを考えているのですか。

一つだけ思いつくのは、リポーター(その蛋白の下流で動く遺伝子のプロモーターとか)をTransientに導入してリポーターの蛍光などのシグナルで分けるというやり方ですが、すべての細胞に一様にリポーターが入るわけではないのでどうだろう、ルシフェラーゼアッセイのように導入効率補正ができる工夫が必要かもしれません。

もう一つのやり方はそのFLAGTagたんぱく導入のときに薬剤耐性マーカーを使っているでしょうから、導入株を作ったときの薬剤の濃度より高い濃度にさらしてしばらく培養して低発現の細胞を除く。ただどこまでうまくいくかわかりませんので、もう一度FLAGTagたんぱく導入をして、より高い薬剤濃度で選択するほうがベターかも。

Flagタグ融合タンパク質を強発現している細胞の選別 削除/引用
No.10852-1 - 2022/10/08 (土) 01:19:50 - JSS
ウイルスを使って、Flagタグ融合タンパク質のpolyclonalな安定株を作成しました。

特定の1細胞を解析するとバイアスがかかる可能性があるため、polyclonalな状態を維持したままで、Flag融合タンパク質を強発現している細胞を選別したいと考えています。

細胞質に存在するタンパク質を導入しているのですが、Flow等で、分画化することは可能でしょうか?

あるいは何か他にいいアイデアはありますでしょうか。

3件 ( 1 〜 3 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。