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(無題) 削除/引用 No.10841-5 - 2022/10/04 (火) 14:01:25 - おお 構造に変化がある事が前提のようですが、そうなのでしょうか。若干の歪みとか見れないもんでしょうかね。スーパーインポーズで構造組み立てるとむりなんかな。

(無題) 削除/引用 No.10841-4 - 2022/10/04 (火) 11:58:01 - HHE 自分が調べた限りでは、alfafoldはde novo predictionは得意ですが、mutagenesisになると信頼性はないという結論に達しているようです。

(無題) 削除/引用 No.10841-3 - 2022/10/04 (火) 11:54:52 - おお Free energyというか、安定性のエナジーベースの計算結果とかぐらいなら出てるか、モデルを３Dイメージで表示させる際などに計算してくれたりするから、安定性の比較ぐらいはできるはず。

(無題) 削除/引用 No.10841-2 - 2022/10/04 (火) 10:58:59 - AA alfafold2やrosettafoldあたりの機械学習ベースのやつがいいと聞きました

遺伝子変異によるタンパク質構造変化予測 削除/引用 No.10841-1 - 2022/10/04 (火) 10:47:40 - HHE ある遺伝性疾患で点突然変異を同定しました。 遺伝子変異によるタンパク質構造変化予測を行いたいのですが、SWISS modelで予測したところ、全体的な構造変化は一切ありませんでした。 タンパク質の構造は素人で、そこまで深く研究を行うつもりはないのですが、Figureとして1つ提示しようと思っています。 みなさんどうやって構造変化を予測されているのでしょうか？

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