BioTechnicalフォーラム [【質問】細胞のダメージを定量化する方法]

【質問】細胞のダメージを定量化する方法

No.10840-TOPIC - 2022/10/03 (月) 11:06:59 - 匿名希望

現在細胞培養過程での細胞操作におけるダメージを軽減する方法について検討を行うことを考えております。種々の文献から細胞に圧がかかることで細胞にダメージを与えていることは明確だと思いますが，細胞死まで起こらないレベルのダメージを定量化する方法についてなかなか情報が見つかりません。もし何かいいアッセイの方法をご存じの方がいらっしゃいましたら，ご教授いただけますと幸いです。よろしくお願いいたします
　

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No.10840-4 - 2022/10/04 (火) 17:31:47 - 匿名希望

皆様

私の曖昧な質問にも関わらず真摯にご回答いただきありがとうございます。ご指摘いただいた”ダメージ”の定義を明確にすることと，アドバイスいただいた評価項目を確認すること，実験操作や生理的な部分の影響を取り除いて実験可能かということを再確認したいと思います。

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No.10840-3 - 2022/10/04 (火) 00:09:29 - ml

この研究でどういったことをダメージと定義するか、どのようなタイプのダメージを調べるのかをまず決めないと先に進めることが難しいような気がします。ダメージというと漠然としていてイメージでどうにでも解釈できてしまうので、環境からの干渉に対する細胞の反応という理解ではダメでしょうか。細胞がストレス応答を発動させるような事態を想定しているならば、Hspとかストレス応答関連遺伝子の発現とかもありますが、たぶん、普通の細胞培養操作でも影響があると思うので安定したデータを取得するには実験系をよく検討された方が良いように思います。こうしたことの情報が見つからないのは、（そもそも対照群となるダメージのない理想的な状態を作ることが実際に可能なのかどうかなど）実験系をコントロールすることが困難だからではないでしょうか。

進展刺激など細胞に物理的な力がかかるだけでもトランスクリプトームは有意に変化しますので、ピペッティングなどでもたぶんそのようなことは一過的にせよ起きていると思いますし、接着細胞をdishから剥離すれば時間依存的にアノイキシスのシグナルとかも動き出すような気がします。

(無題)

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No.10840-2 - 2022/10/03 (月) 23:30:38 - おお

>[Re:1] 匿名希望さんは書きました :
> 現在細胞培養過程での細胞操作におけるダメージを軽減する方法について検討を行うことを考えております。種々の文献から細胞に圧がかかることで細胞にダメージを与えていることは明確だと思いますが，

そういう文献があるのだから、それらの文献にヒントがないですか。
あと圧がダメージと言うのはわからなくもないのだけどぼんやりしすぎてて、もう少し具体的にならないかなと思います。一瞬内容物が出るが修復されるとか、、、
ま、あまり具体的ではないので、ちょっとmechanical stress で調べると、
doi.org/10.1016/j.cell.2010.12.031
caveola flattening and disassembly

その他、mechanical stress で調べたらいいかと思います。mechanical stress によるシグナリングなども見つけられるだろうし、そこからレポーターを作るという手もあるので。しかし生理的な範囲の物もあり（血管内で作用する圧とか（高血圧になると違うかもしれないからそこは使えるのかも）、ヒトが立っている状態にかかる圧とか）、なのでダメージというのを漠然としないほうがいいと思う次第です。

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No.10840-1 - 2022/10/03 (月) 11:06:59 - 匿名希望

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