Bio Technical フォーラム

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遠心の単位について トピック削除
No.10787-TOPIC - 2022/09/17 (土) 09:05:23 - momoko
はじめまして。よろしくお願いします。

実験初心者です。
マウスの爪からDNA抽出をしようとkitを購入しました。
ニッポンジーンのISOHAIRです。
人間用ですがマウスからもOKでした。

プロトコールの中に 遠心11Kxg とありますが
これは11キロ、xgで回すということでしょうか?

実験室にある遠心機は3000xgが上限です。

キロの単位がわかりません。

ネットで検索してもわかりませんでした。

よろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.10787-10 - 2022/09/19 (月) 18:54:35 - G25
使っているキットがこれなら、EtOH ppt思いっきりあります。

https://www.nippongene.com/siyaku/product/extraction/isohair/isohair.html

(無題) 削除/引用
No.10787-9 - 2022/09/19 (月) 10:15:54 - momoko
皆様

ありがとうございます!
超初心者レベルの質問にここまでお答え頂いてとても有り難いです。
助かります。

zam様
プロトコール通りの回転数でしなければと思い込んで
11Kで回せる遠心機を借りることができないか探していました。
書き込みを拝見すると、
時間を延長して対応することもできるんですね!!
借りて迷惑をかけたくないので時間延長してまずはやってみます。

メーカー見てきたけど様

メーカー見て頂いてありがとうございました。
ローターを変えれば回転上限が変わるのは知りませんでした。
メーカー(日立)の説明書を読んでから質問すべきだったかもです。
お手数おかけしました。でもとても助かりました。

G25様

やはり代替できるんですね!
でも爪からはエタ沈での低速遠心は難しいんですね。。。
プロトコールにエタ沈は無いようですが、あるかもしれず、
実験してみてまた検討します。
ローターがあれば解決するかもしれません。

爪からは初めてで緊張しています。
でも皆さんに返答いただいてやる気が出てきました!
重ね重ねありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.10787-8 - 2022/09/17 (土) 19:10:01 - G25
一応、遠心力x遠心時間(g・minとかg・hr)が同じくらいなら代替できると言いますから、
11k xg, 5 min を3k xg なら20 min以上になりますかね。
しかしPCI抽出はいいとしても、EtOH沈殿は10 x以上でなければやりたくない。
エタノールを加えたときゲノムDNAが繊維状に見えるくらい多ければ、低速遠心でも、あるいは遠心なんかせずにガラスキャピラリーなんかで釣り上げてでも回収できますけど、爪からじゃ無理。

それと多分、1.5 mLの微小遠心管(いわゆるエッペンチューブタイプ)が適していると思うので、それ用の遠心機でなければうまくないでしょう。

(無題) 削除/引用
No.10787-7 - 2022/09/17 (土) 18:56:26 - メーカー見てきたけど
3000gなら50mL遠沈管用だろうか
ローターを替えればそれにあった回転数上限に変わるけど

一般的な卓上遠心機が2000g前後として
3000gの卓上遠心機(1.5mL用x6〜8本)しかない環境で
ISOHAIRで処理するなら
1.5mLスケールで分離する普通のフェノクロ・エタ沈レベルだから
プロトコール通りの遠心時間でも落ちると思う。
できなかったら
長めに15分→30分〜1時間にするのもいいかと。

極論、分液なら分液漏斗でほっとくのを遠心で時間短縮してるようなもんだし
析出したDNAが遠心数の違いで落ちないよりも
DNAペレットが見えないからTube内壁に張り付いてロス
する可能性の方が高いんじゃない

(無題) 削除/引用
No.10787-6 - 2022/09/17 (土) 11:50:54 - zam
高速遠心機をお持ちでないのでしょうか?

余談ですが、回転数が低くても遠心時間を延ばすことで、落とすことは可能です。

たとえば、一般的な微量高速遠心機で11,000 x gの5分間は、一般的なスイングローターで3,000 x gの1時間ぐらいに相当すると思います。
同様に、微量高速遠心機で11,000 x gの15分間は、スイングローターで3,000 x gの3時間ぐらいに相当すると思います。
計算が違っていたらご容赦ください。

私は実際やったことはありませんし、あくまでも計算上のことです。

もちろん、お勧めはしません。
品質も収量も期待できません。
そちらの遠心機が長時間の遠心によって不具合が生じるかもしれません。

ただ、それしか遠心機がない中で、とにかくどうしても物を落としたいのであれば、できなくもないということです。

(無題) 削除/引用
No.10787-5 - 2022/09/17 (土) 09:47:35 - momoko
おお様

ありがとうございました。
助かりました。
利用予定の遠心機は3キロまでとわかりました。
3キロxg 
ありがとうございます。

(無題) 削除/引用
No.10787-4 - 2022/09/17 (土) 09:43:34 - momoko
G25様ありがとうございます。

キロは1000倍との説明もありがとうございました。
11,000xg で遠心すれば良いのですね。

このような初歩的な質問にお答え頂いてありがとうございました。

今、確認したところ利用予定の遠心機は
やはり上限が3000xgまでしか回せませんでした。

(無題) 削除/引用
No.10787-3 - 2022/09/17 (土) 09:42:15 - おお
>[Re:1] momokoさんは書きました :
> はじめまして。よろしくお願い
>
> 3000xg
>
=3 キロg

(無題) 削除/引用
No.10787-2 - 2022/09/17 (土) 09:20:39 - G25
k (kilo)は1000倍ってことですから、
11は11,000です。

遠心の単位について 削除/引用
No.10787-1 - 2022/09/17 (土) 09:05:23 - momoko
はじめまして。よろしくお願いします。

実験初心者です。
マウスの爪からDNA抽出をしようとkitを購入しました。
ニッポンジーンのISOHAIRです。
人間用ですがマウスからもOKでした。

プロトコールの中に 遠心11Kxg とありますが
これは11キロ、xgで回すということでしょうか?

実験室にある遠心機は3000xgが上限です。

キロの単位がわかりません。

ネットで検索してもわかりませんでした。

よろしくお願いします。

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