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(無題) 削除/引用 No.10786-3 - 2022/09/17 (土) 11:06:37 - AA 普通にソーター通すと性質が変わってしまう細胞などもありますね。 対策としては固定してから核でソーティングするなどの対応もあります

(無題) 削除/引用 No.10786-2 - 2022/09/17 (土) 09:49:34 - おお >[Re:1] melさんは書きました : > シングルセル化の際、コラゲナーゼ、DNase等で37℃インキュベート、ような処理が行われています。 > 素朴な疑問なのですが、37℃でインキュベートするとRNaseによりRNAがどんどん分解されてしまい（少なくとも変動してしまい）、生体内での遺伝子発現状況を反映しないように思われるのですが、これは間違いでしょうか。 反映しないとまで言えるかは微妙ですが、それが方法論としての限界と言う認識を持つべきでしょう。

シングルセルRNA-seqについて 削除/引用 No.10786-1 - 2022/09/16 (金) 20:24:27 - mel こちらでいつも勉強させていただいております。 最近身近に行われるようになったシングルセルRNAシークエンスですが、 所属ラボでも共同研究で今後行う方針となり色々調べております。 大体どのプロトコルを見ても、 シングルセル化の際、コラゲナーゼ、DNase等で37℃インキュベート、ような処理が行われています。 素朴な疑問なのですが、37℃でインキュベートするとRNaseによりRNAがどんどん分解されてしまい（少なくとも変動してしまい）、生体内での遺伝子発現状況を反映しないように思われるのですが、これは間違いでしょうか。

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