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(無題) 削除/引用 No.10666-3 - 2022/07/29 (金) 02:33:01 - おお ＞結論にもっていきたい ちょっと違和感のある表現ですね。結論ありきで実験を進めると、その結論が実際と違った場合色々大変なことになる。まあそういう仮説を立てたということでしょうけど。 誤差という話は統計的には計算すればいいだけの話だと思いますが、その小さいと思われる差で考えている論文の中で十分役割を担ってくれるのか、検出系が発揮できる範囲の差が出ているかということが考えるべきところだと思います。 後者に関してはqPCRは１.５倍以上の差はなんとか見れるだろうという個人的な見方をしています。0.9から1.5倍ということは平均値は明らかに１.５倍未満で検出系の誤差に埋もれるだろうと感じますし、実際有意差が出ないのではないでしょうか。仮に相当正確に数値をだす腕を持ってたとして、ハウスキーピングの発現量が微動だにしないということは現実的ではないですから、それくらいの差でどれだけ意味があるか疑ってしまいます。変なことをいうとハウスキーピングの選び方次第で１.５倍以上の差は出るかもしれないのも事実です。 結論云々よりそのデーターをもってラボ内で議論して方向性を決めることをおすすめします。

(無題) 削除/引用 No.10666-2 - 2022/07/28 (木) 14:20:31 - qqq >[Re:1] Aさんは書きました : > その結果がそれぞれ0.9〜1.5で収まるのですが、目的遺伝子/ハウスキーピング遺伝子の値はこんなものでしょうか。 ものによる(あなたの実験ではそうだったのだろう)としか。 > 細胞刺激なしに対して細胞刺激ありの方が優位に増えたという結論にもっていきたいのですが、このような微量な変化だと厳しいのかなと思います。 そういう結論ありきの言い方はしないほうがいいですよ。 有意差がつくならそう主張してもいいけど、それに生理的にどれだけの意味があるのかとは問われるでしょうね。 変動幅が少ないからというより、投稿先にもよるでしょうが、mRNAで何倍に増えていようが遺伝子のみの解析では大概問われます。変化が真であるかと生理的意味は別なので。

qPCR 検量線 削除/引用 No.10666-1 - 2022/07/28 (木) 12:11:50 - A qPCR初心者です。 検量線法で実験を行っているのですが、最終的に値を目的遺伝子/ハウスキーピング遺伝子で算出するかと思います。 その結果がそれぞれ0.9〜1.5で収まるのですが、目的遺伝子/ハウスキーピング遺伝子の値はこんなものでしょうか。 細胞刺激なしに対して細胞刺激ありの方が優位に増えたという結論にもっていきたいのですが、このような微量な変化だと厳しいのかなと思います。 0.9〜1.5で収まるのは誤差の範囲でしょうか。それともqPCRの検量線法の結果はこのようなものなのでしょうか。 他の物質での刺激の論文等みていると刺激なしで1、刺激ありで4くらいだったのでそのくらいの差がないと認められないのかなと疑問に思い投稿しました。

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