Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

TT トピック削除
No.10626-TOPIC - 2022/07/14 (木) 17:54:00 - HIF-1αのimmunoblotting
HIF-1αの抗体でwestern blottigするとHIF-1αのシグナルの他に90~60KDaくらいのあたりにシグナルが出ます。抗体変えても同じような感じなのでsplicing variantかなと思うのですが、HIF-1αのsplicing variantとか既に報告あるかどうかご存知の方いたら教えてください。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



4件 ( 1 〜 4 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.10626-5 - 2022/07/15 (金) 07:59:21 - zam
質問者様が既にご存じの情報ならばスルーしてください。

1.
Uniprot
Q16665 HIF1A_HUMAN

ttps://www.uniprot.org/uniprotkb/Q16665/entry#sequences

"This entry describes 3 isoforms produced by Alternative splicing."
「この項目には、オルタナティブ・スプライシングにより生成された3つのアイソフォームが記載されている。」

2.
Pubmed
Hypoxia inducible factor 1alpha gene (HIF-1alpha) splice variants: potential prognostic biomarkers in breast cancer
低酸素誘導性因子1α遺伝子(HIF-1α)のスプライスバリアント:乳がんにおける予後バイオマーカーの可能性

ttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20624301/

3.
Pubmed
A new HIF-1 alpha variant induced by zinc ion suppresses HIF-1-mediated hypoxic responses
亜鉛イオンによって誘導される新しいHIF-1αバリアントは、HIF-1を介した低酸素応答を抑制する

ttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11739637/


4.
Abcam
HIF-1 alpha detection in western blot

"HIF-1 alpha is a major global regulator of hypoxic response, and it is rapidly degraded in oxygenated cells. Degradation can occur within the first five minutes of exposure to normoxia, even after cells have been growing for long period in hypoxia."
「HIF-1 alpha は低酸素応答の主要なグローバルレギュレーターであり、酸素化された細胞では急速に分解される。分解は、低酸素状態で細胞が長期間増殖した後でも、正常酸素への曝露後最初の5分間で起こり得る。」

ttps://www.abcam.com/protocols/hif-1-alpha-detection-in-western-blot


1-3はHif-1αのスプライシング・バリアントについて。
4はHif-1αのデグラデーションについて(Hif-1αのウェスタンで複数のバンドが出る原因について)。

TT 削除/引用
No.10626-3 - 2022/07/15 (金) 01:08:01 - HIF-1αのimmunoblotting
も考えたのですがあれはプロテアソームの中でバラバラになると思うので限定分解みたいにどっか決まったとこでバシッと切れて綺麗にいい感じの断片化かなあとか思って、ええ。

(無題) 削除/引用
No.10626-2 - 2022/07/14 (木) 20:15:34 - ww
degradationでは?

TT 削除/引用
No.10626-1 - 2022/07/14 (木) 17:54:00 - HIF-1αのimmunoblotting
HIF-1αの抗体でwestern blottigするとHIF-1αのシグナルの他に90~60KDaくらいのあたりにシグナルが出ます。抗体変えても同じような感じなのでsplicing variantかなと思うのですが、HIF-1αのsplicing variantとか既に報告あるかどうかご存知の方いたら教えてください。

4件 ( 1 〜 4 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。