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(無題) 削除/引用 No.10613-3 - 2022/07/15 (金) 14:23:38 - toto NewtonBioさんが聞かれておられるのは、細胞の輪郭の蛍光強度分布を測りたい、ということでしょうか。それでしたら、CellMagicWandというImageJのプラグインが使えそうです。現在はGihubの ttps://github.com/fitzlab/CellMagicWand にあるので、この.jarファイルをダウンロードしてImageJのプラグインフォルダに入れてImageJを起動し、 画像（８bit）を開いて、細胞等の閉じた構造をwand toolでクリックします。 これで輪郭が選択されます。この線上の輝度値はAnalyze＞PlotProfile をクリックするとtableとなって出てきます。 このとき、輪郭線を広くしたい（つまり少し広い領域にしたい）ときはline width (パネルの線の絵のところをダブルクリック）すると、変えれます。ただこれを増やすと輝度のない部分も含むことにはなります。問題はないでしょうけど。

(無題) 削除/引用 No.10613-2 - 2022/07/15 (金) 12:21:06 - て わたしには質問からだとイメージがわかりませんでした。 もう少しやりたいことを具体的に書いていただけると回答できると思います。 例えば位置というと一般的にはxyもしくはxyzで表されるもので1次元的に表現することは不可能かと思われます。 また細胞のふちに沿って、というのはなんらかの方法で細胞膜を認識して、細胞膜における発現強度を知りたい、ということですか？もしくは蛍光により細胞体が光っている中で、細胞とそれ以外の境界面の蛍光強度が知りたいということですか？ 画像解析ソフトであれば大抵のことは可能だとは思いますが、利用可能な画像解析ソフトはありますか？

tifファイルの位置と蛍光強度のグラフ作成 削除/引用 No.10613-1 - 2022/07/11 (月) 16:49:35 - NewtonBio はじめまして。私、共焦点顕微鏡を用いて蛍光タンパク質を発現させた細胞をtifファイルで保存しているのですが、このとき細胞の縁に沿って蛍光強度のに関するグラフを作成したいです。ヒストグラムではなく、細胞の縁に沿った曲線の位置をx軸に、蛍光強度がy軸に表示させるようにしたいです。このような手段があれば教えていただきたいです。ダイレクトな方法がないとしたらそれに近い方法でも構いませんのでよろしくお願いいたします。

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