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(無題) 削除/引用 No.10488-4 - 2022/06/15 (水) 23:28:22 - クリスパー 情報をありがとうございます！！

(無題) 削除/引用 No.10488-3 - 2022/05/29 (日) 13:40:30 - AA Bulkで読んでマルチアリルになっているものをそのまま解析できるツールも最近出てきていますね。 ttps://www.liebertpub.com/doi/10.1089/crispr.2021.0113

(無題) 削除/引用 No.10488-2 - 2022/05/29 (日) 12:53:09 - mont 目的遺伝子のアレル毎に違う変異が起こるから、異なるシークエンス結果が重なって読めない、、、ってことなのではないでしょうか。プライマリーでなければ、ほとんどの培養細胞の染色体は2倍体ではなく、4倍体とか6倍体とかなので、現実的には4種類、6種類の変異(または野生型)が混在することになるので。

CRISPR編集後のindel解析 削除/引用 No.10488-1 - 2022/05/25 (水) 06:01:41 - クリスパー 培養細胞をCRISPR/Cas9で編集し、ある遺伝子をノックアウトしました。編集後のIndelの確認のため、bulkでシーケンスをしました。シーケンスファイルを読み込んでindelの有無を解析したく、indigoというソフトを使いました。結果の解釈、とくにdecomposition errorのプロットの意味が分からず困っています。どなたかご教示いただけないでしょうか。

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