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エンハンサー活性=転写活性?
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No.10445-TOPIC - 2022/05/06 (金) 19:16:53 - 遺伝学
ショウジョウバエなどで「エンハンサートラップ系統」という遺伝子組み換え生物がよく用いられると思います。エンハンサーの活性をモニターできるということで、ほぼイコール転写活性の指標として用いられていると思います。これは本当に「ほぼイコール」なのでしょうか。エンハンサー活性は高いけど転写はされていないケースってないのでしょうか(そういうのは稀でしょうか)。
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No.10445-4 - 2022/05/07 (土) 22:10:19 - クァswでfrtgyふじ
転写促進が見られないがエンハンサー活性は高いという(両立しないような気がする)結果はどのようにして出て来たのでしょうか。
(無題)
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No.10445-3 - 2022/05/07 (土) 02:38:46 - おお
エンハンサー活性をどのように定義しているのでしょうか。普通はエンハンサー活性は転写を促進する活性と考えるわけですから、エンハンサー活性が高くても転写が促進しないという事はないと考えるもんだと思います。
エンハンサー領域に抑制因子が結合して転写が負に制御されるような話はあったと思いますが、その場合はエンハンサートラップでも転写活性が検出されないわけで、、、
(無題)
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No.10445-2 - 2022/05/06 (金) 19:30:30 - G25
転写を正に調節するのがエンハンサーですから、転写活性の上がりを見ているのは当然かと。
エンハンサートラップコンストラクトはマーカー/エフェクター遺伝子を、最小プロモータにつなげたものです。エンハンサーとプロモータがちょうどいい位置関係でコンストラクトが挿入したらエンハンサーの活性に従ってエフェクターが発現します。しかしそうでなければ、エフェクターの発現が起こらないことも当然あります。
エンハンサー活性=転写活性?
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No.10445-1 - 2022/05/06 (金) 19:16:53 - 遺伝学
ショウジョウバエなどで「エンハンサートラップ系統」という遺伝子組み換え生物がよく用いられると思います。エンハンサーの活性をモニターできるということで、ほぼイコール転写活性の指標として用いられていると思います。これは本当に「ほぼイコール」なのでしょうか。エンハンサー活性は高いけど転写はされていないケースってないのでしょうか(そういうのは稀でしょうか)。
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