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IgGの定常領域に結合するタンパク質 トピック削除
No.10399-TOPIC - 2022/04/15 (金) 04:50:27 - DDC
ある表面抗原に結合するタンパク質の同定を目指していたところ、IgGの定常領域が引っかかりました。

こういう結合は調べた限りではあまりないのですが、合理的でしょうか?あるいは抗体の一部なので、非特異的に結合しているだけと捉えるのが妥当でしょうか?生体内で結合が意義を持っているのか、結論が出ません。

自分だけでは結論が出ないので、少し意見を聞かせていただきたく投稿させていただきます。
 
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No.10399-9 - 2022/04/17 (日) 17:11:42 - qq
>データベースでhitすることがあるのは普通にあり得る。
そうなんですか、ちょっとよくわからないけど、私が不勉強なのかもしれない。

(無題) 削除/引用
No.10399-8 - 2022/04/16 (土) 15:21:00 - b
可変領域でも体細胞超変異を経ずに分泌される抗体もあると思う(確かB1細胞が作る自然抗体とかがそうだと思った)のでデータベースでhitすることがあるのは普通にあり得る。

質問された方の言う定常領域と可変領域が正しいかどうかはこれはまた別の問題と思うので、質問者の人はこの点をよく確認してほしい。

(無題) 削除/引用
No.10399-7 - 2022/04/16 (土) 10:37:08 - qq
>IgGの定常領域が引っかかりました。
同じ生物試料由来のIgGの定常領域なのだろうか?ウシ由来だったりしない?
IgGの可変領域にヒットするデータベースは考えられないでしょ?
だから、引っ掛かったのがIgGなのかIgGの定常領域なのかは判らない。

(無題) 削除/引用
No.10399-6 - 2022/04/15 (金) 19:01:36 - b
これだけの情報で的確に回答できる人は多分いないと思うので、同定に至る実験のプロセスを書いてください。

(無題) 削除/引用
No.10399-5 - 2022/04/15 (金) 10:18:48 - G25
Protein A/Gとか補体とかFcレセプターとか
視野に入った上で言ってる?

(無題) 削除/引用
No.10399-4 - 2022/04/15 (金) 05:39:44 - おお
>定常領域は一応、抗原への結合を担う部分ですよね?

抗原への結合を担う部分は可変領域ではないですか?
可変領域(Fab)にしてもすべて配列が異なるわけでもないでしょうから、共通した配列の部分がたんぱくと結合して生理的役割を果たしている可能性を考えることはそんなに変なことではないと思いますよ。

(無題) 削除/引用
No.10399-3 - 2022/04/15 (金) 05:28:10 - DDC
返信、ありがとうございます。定常領域は一応、抗原への結合を担う部分ですよね?となると、何かstickyなものなのではと勘ぐってしまうのですが。

(無題) 削除/引用
No.10399-2 - 2022/04/15 (金) 05:25:16 - おお
あなたの実験においてどういう意味があるかは検討がつきませんが、
Fc receptorやFCGBP(IgGFc-binding protein)など、Fc領域に結合するたんぱく質はあります。これらのたんぱくの結合は意味がないというのでしょうか?

IgGの定常領域に結合するタンパク質 削除/引用
No.10399-1 - 2022/04/15 (金) 04:50:27 - DDC
ある表面抗原に結合するタンパク質の同定を目指していたところ、IgGの定常領域が引っかかりました。

こういう結合は調べた限りではあまりないのですが、合理的でしょうか?あるいは抗体の一部なので、非特異的に結合しているだけと捉えるのが妥当でしょうか?生体内で結合が意義を持っているのか、結論が出ません。

自分だけでは結論が出ないので、少し意見を聞かせていただきたく投稿させていただきます。

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