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qPCRの結果のグラフの表示の仕方について
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No.10387-TOPIC - 2022/04/08 (金) 21:21:11 - 教えてください
qPCRの結果をFigにする際に、対照群を1とした相対値で示すつもりがないとき縦軸を2のーΔCt乗でグラフ書いても良いでしょうか。qPCRは2の-ΔΔCt乗でないとダメなのでしょうか。
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No.10387-4 - 2022/04/12 (火) 17:32:23 - asan
科学的に筋が通ったデータならばどう示すかは自由だと思います
ただ、そうしなくてはいけない理由がないのにあえて分かりにくい示し方をすることでレビューする人の誤解が生じたり、こいつはちゃんと解析できてないのではないか?とうがった見方をされて面倒なことにならなければいいですけどね。
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No.10387-3 - 2022/04/09 (土) 13:53:56 - -_-
縦軸がNormalized to GapdhとかRelative mRNA level to GAPDHとかハウスキーピング遺伝子と比較した表記のことはあります。
(無題)
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No.10387-2 - 2022/04/09 (土) 01:22:14 - おお
あなたが示したいことを的確に表しているならそれでもいいんじゃないでしょうか。駄目とかいう思考はやめたほうがいいですよ。組織間の発現の違いとかだとどれを基準にとかない場合もあるでしょうしそういうのはΔCtで表現するのもありだろうと思うし。
qPCRの結果のグラフの表示の仕方について
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No.10387-1 - 2022/04/08 (金) 21:21:11 - 教えてください
qPCRの結果をFigにする際に、対照群を1とした相対値で示すつもりがないとき縦軸を2のーΔCt乗でグラフ書いても良いでしょうか。qPCRは2の-ΔΔCt乗でないとダメなのでしょうか。
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