全5件 ( 1 〜 5 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

(無題) 削除/引用 No.10384-5 - 2022/04/16 (土) 01:14:44 - おお >[Re:4] wwさんは書きました : > ただ、私が扱っている系では、Test群で発現量の変化がせいぜい1.5-3倍程度しかないためかもしれません。 ありがとうございます。1.５ならなんとか差が見れるって感じですかね。 > 別スレでも議論されているようにCt値が33や35を越えてくると、当然SDは増大しますね。 そうですね。そのへんのサイクルになるとチューブに１コピーとか２コピーというレベルに近づいてきますので、Well間でCtが１違ってもおかしくない状況ですよね。

(無題) 削除/引用 No.10384-4 - 2022/04/15 (金) 22:00:54 - ww >[Re:3] おおさんは書きました : > 実際ControlとTestの比較をしたとき、ControlはSD0.2程度で収まるけどTestの数字は少しバラけるとかないですか？ Control=対照群、Test=刺激等の介入群と理解しましたが、 群によって変わる傾向はなかったと思います。 ただ、私が扱っている系では、Test群で発現量の変化がせいぜい1.5-3倍程度しかないためかもしれません。 また、先程示した数字はCt<30未満くらいの理想的に定量ができる範囲の結果で、 別スレでも議論されているようにCt値が33や35を越えてくると、当然SDは増大しますね。

(無題) 削除/引用 No.10384-3 - 2022/04/15 (金) 10:45:31 - おお >[Re:2] wwさんは書きました : > 0.1-0.5くらい。ただし、内在性コントロールで補正すると最大でも0.2程度 > > こんなところです。 ありがとうございます0.2は精度が高いですね。統計的にただしいかはおいておいてCIで0.4としてこれが重ならないようにするなら平均で0.8の差がないと確実な有意差が出にくいのかもしれませんね。1.75倍ぐらいの発現量の差は確実にみれるだろうって感じでしょうかね。 実際ControlとTestの比較をしたとき、ControlはSD0.2程度で収まるけどTestの数字は少しバラけるとかないですか？

(無題) 削除/引用 No.10384-2 - 2022/04/15 (金) 09:29:06 - ww これ私も興味があるので遅まきながら きちんと統計とって確かめてはいませんが 独立した実験のSD 0.1-0.2程度（になるようプライマー毎に最適化した条件でrunしている） Technical triplicateのSD 0.1-0.5くらい。ただし、内在性コントロールで補正すると最大でも0.2程度 こんなところです。

qPCR定量の精度 削除/引用 No.10384-1 - 2022/04/07 (木) 16:54:29 - おお 皆さんの実際のデーターであるコンディションの細胞からRTqPCRをしたとき、独立した実験を繰り返したときddCTとかどれくらいのSDになりますか。またテクニカルTriplicate（同じコンディションの細胞を複数のDish（Well)した）ときdCTのSDはどれくらいになってますでしょうか。 参考にさせてもらえば幸いです。ぶっちゃけ差としてどれくらいまで検出可能でしょうか。１．５倍ぐらいは楽勝でしょうか(生理的に意味があるかどうかは置いといて)。

全5件 ( 1 〜 5 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

パスワードを入力してチェックした記事を

チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する 名前  メール  　アドレス非公開    タイトル  本文       設定  クッキーを保存（次回の入力の手間を省けます） 上に上げない（トピックの一覧で一番上に移動させません） 解決（問題が解決した際にチェックしてください） 暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。 送信

---

〔使い方〕 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。

---