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(無題) 削除/引用 No.10371-6 - 2022/03/30 (水) 19:53:04 - vh卯hβぬ イマイチよくわからないので誤解してるかもしれないですが、3つの実験群があって１群あたりのサンプルサイズが3個体なり３検体ということでしょうか。 もしそうならば１枚のメンブレンで９サンプル同時に泳動して定量するのが正攻法と思います。ていうか、同時に泳動して同一メンブレンで比較しないと（半定量ではありますが）正確な比較ができないのでそうするよるほかないと思うし。 Figureの中で、westernのデータがスペースを無駄に占めるのが嫌なら、別途それぞれの群から１サンプル選んで3レーン流してwesternしてrepresentative dataとすれば良いと思います。全体のblotはサプリメンたりーに乗せればいいし。 それか、A群（１、２、３）B群（１、２、３）C群（１、２、３）として A1 B1 C1 A2 B2 C2 A3 B3 C3 の順に並べて泳動して、定量評価して、A1 B1 C1の所を切り出してFigにするとかもできるのでは。全体はサプリメンたりーに乗せて、ここを切り出してFigの図にしたと一言書いておけばいいと思う。

(無題) 削除/引用 No.10371-5 - 2022/03/30 (水) 18:21:02 - asan 嘘はいけないと思いますけど、biological replicatesという意味でのN=3ならば、ぶっちゃけ技術的に並行処理してN=3になったからと言って嘘とまでは言えないとおもいますから別にいいんじゃないかなって思います。 こういうと、こうでなければいけない！！みたいなことを主張する人がいるかもしれませんけど、結構統計処理とかreplicate処理の解釈はこの業界”曖昧”だったりもするので、あきらに嘘はいけませんけどその辺は自分なりにどこを基準にして実験をやるかを決めて、それできちんとレプリカ処理で反映させたいことが検証できるという自信があるならそれでいいと思いますけど。 極端な話、qPCRなどのN=3を3 well並行処理してそれでN=3でやる実験なんてたくさんあると思いますし、完全なindependentな実験を全てN=1づつ3回別日程でやってる論文なんてほとんどないと思いますしね。実験にもよりますし、複数の実験で矛盾しない結果が出てるかどうか主張の整合性とその根拠が妥当かどうかの方が重要ではないかと。 もちろん、やってないのに嘘とか、以前問題になったゲルのごまかすための切りはりなどは問題外だと思いますが。

(無題) 削除/引用 No.10371-4 - 2022/03/30 (水) 11:13:19 - さくら おおさん 問題ないとのこと、ありがとうございます。 G25さん >聞かずもがなかもしれませんが、ちょっと気になったのは、 ３群の各群からn=3というのは、各群で実験を triplicateして、そのそれぞれを独立したサンプル　n=1としているですよね。 はい、biological replicatesで3サンプル泳動しています。 >それは3群の各群で独立した実験をtriplicateしているということですよね？ ご指摘の通りです。

(無題) 削除/引用 No.10371-3 - 2022/03/30 (水) 10:03:17 - G25 triplicateの実験を同じゲル／メンブレン上でやるか、それぞれ独立してやるかはあまり重要でないと思います。むしろ、同じ同じゲル／メンブレンにしたほうが、検出やトランスファなどの条件が均一になっていいくらいじゃないかと思います。 聞かずもがなかもしれませんが、ちょっと気になったのは、 ３群の各群からn=3というのは、各群で実験を triplicateして、そのそれぞれを独立したサンプル　n=1としているですよね。 測定上のテクニカルなブレを丸めるために1 サンプルを3レーンに分けて泳動しているんじゃなくて？ >上記のような条件でも3群、n=1の3レーンを3回行ってfigureにしている それは3群の各群で独立した実験をtriplicateしているということですよね？

(無題) 削除/引用 No.10371-2 - 2022/03/30 (水) 01:56:05 - おお 別にいいと思います。最近はN=3で行ったならそのデーターをすべてSIに示すとか、少なくともレビューアーに見せるということはよくあるので、全部いっぺんに示していると手間が省けます。

ウエスタンブロット、1枚のメンブレンでn＝3はダメ？ 削除/引用 No.10371-1 - 2022/03/30 (水) 00:49:09 - さくら ウエスタンブロットについてご意見を頂けますでしょうか。 トピックタイトルのように、ウエスタンでn=3を1枚のメンブレンで行ってfigure用のデータを出す事はあまり良くないのでしょうか。 具体的には、3群のサンプルをn=3の9レーンでまとめて流したいと考えています。 ただ論文を見ていますと、上記のような条件でも3群、n=1の3レーンを3回行ってfigureにしているものが殆どです。(まとめて流しているものもたまに見かけないこともないですが) 勿論、何回か実験を行って再現性もとっていますし、バンドを全部出すので正直なデータだとも思うのですが..皆様のご意見を頂けますでしょうか。

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