Bio Technical フォーラム

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Metascapeによるエンリッチメント解析 トピック削除
No.10347-TOPIC - 2022/03/17 (木) 17:37:24 - ウェットが過ぎて
Metascapeによるエンリッチメント解析に詳しい方はいらっしゃいますでしょうか。

Menbershipで絞り込んだGene IDをapplyし、Enrichment analysisをすると絞り込んだものが反映されていないと思われる結果が出てしまいます。

正しいやり方をご存じの方はいらっしゃいませんでしょうか。

所属先はウェットのラボで詳しい人がおらず解決できませんでした。

よろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.10347-3 - 2022/03/17 (木) 18:50:24 - あの
特に詳しい訳ではありませんが、この手の解析は、次の2点に注意が必要です。


アップロードする遺伝子の数が多すぎても少なすぎてもダメ


所詮は既知の知識への照会でしか無いので、調べたい臓器によっては、思うような結果が得られない

(無題) 削除/引用
No.10347-2 - 2022/03/17 (木) 17:39:48 - ウェットが過ぎて
https://togotv.dbcls.jp/20160927.html
TOGO TVで言うところの3分33分あたりの「Kinaseに関するGene ID」のように絞りこんだグラフを出したいのです。

Metascapeによるエンリッチメント解析 削除/引用
No.10347-1 - 2022/03/17 (木) 17:37:24 - ウェットが過ぎて
Metascapeによるエンリッチメント解析に詳しい方はいらっしゃいますでしょうか。

Menbershipで絞り込んだGene IDをapplyし、Enrichment analysisをすると絞り込んだものが反映されていないと思われる結果が出てしまいます。

正しいやり方をご存じの方はいらっしゃいませんでしょうか。

所属先はウェットのラボで詳しい人がおらず解決できませんでした。

よろしくお願いします。

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