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市販のfc融合タンパク質を用いて新規結合タンパク質を同定する
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No.10310-TOPIC - 2022/03/02 (水) 22:19:19 - しんや
市販のfc融合タンパク質を用いてcell lysateと混ぜた後、質量分析で、新規結合タンパク質を同定するようなことは可能でしょうか?
文献検索をかけてもあまりやっている方がいないようですが。
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No.10310-3 - 2022/03/03 (木) 11:33:34 - toto
もちろん可能ではありますが、Fcは非特異的結合が強いので、今どきはやらないのじゃないかな。今はnanobodyやいろんなツールがあります。
(無題)
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No.10310-2 - 2022/03/03 (木) 04:33:49 - おお
新規が引っかかるか既知しか引っかからないかは運次第だけど、ありえる手法だと思いますよ。確かGSTを使ったリコンビナントなどでプルダウンしているような文献を見たことがある気がする。その「市販のfc融合タンパク質」やらが融合したタンパクの部分がちゃんとした構造をしているか(なにか構造をとるなら)とかいうのは重要な点ですが、既知のタンパクとの結合が示されているのなら新規のものとの結合を否定する要素はないですし。
市販のfc融合タンパク質を用いて新規結合タンパク質を同定する
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No.10310-1 - 2022/03/02 (水) 22:19:19 - しんや
市販のfc融合タンパク質を用いてcell lysateと混ぜた後、質量分析で、新規結合タンパク質を同定するようなことは可能でしょうか?
文献検索をかけてもあまりやっている方がいないようですが。
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