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(無題) 削除/引用 No.10299-3 - 2022/03/01 (火) 12:12:54 - zwx絵rftγ７yh８う covalentな結合だと２量体のまま泳動されるので、それに見合う分子量を示す。トランスグルタミナーゼによるGlnとLys間の架橋にような生理的な翻訳後修飾によるものもあるし、Dityrosineのようなアミノ酸側鎖の酸化傷害に起因する分子間架橋形成とかアルデヒド化合物による架橋など各種ストレスによる分子傷害によるものもある。 non-covalent な結合なら理論的にはダイマーになるはずで、実際に大体はそうなんだが、よくSDS-resistant interactionとか言うのだがSDSでも解体しないような強い相互作用でくっついてるものもたまにあってそういう時はnon-covalentでもモノマーにならない、ていうかオリゴマー化してさらに高分子量にもシグナルが見られることもある。アミロイド線維を形成するようなタンパク質とかでたまにそういうのある。こうしたSDS抵抗性についてはある種の糖鎖も関係してることがあるとかいう論文も昔見たことあるけど詳細忘れた。

(無題) 削除/引用 No.10299-2 - 2022/03/01 (火) 02:16:37 - おお 基本モノマーとして流れると考えるべきですが、そうならないこともあります。 むかし扱ってたタンパクで非常によく似たタンパク質がヘテロダイマーを形成していて、全部ではないけど一部はダイマーの位置に泳動されていた。原因は疎水性が強いためアグってSDSでも解離できなくなったと言われていた。今はその領域の仕事は離れてしまっているけど後日談として、どうやらROS等による酸化によってコバレントに結合してしまった可能性も指摘されていると聞いた。 疎水性の高いタンパクは（特に膜タンパク）はボイルでアグってしまう事があるという話はよく聞く。 あるいはそういう実験中に話ではなく、もともと何らかの酵素反応とかでコバレントに結合しているケースもあるかもしれない。ユビキチンライゲースとかコバレントな結合を触媒するしそんなことが全く起こらないとは言えないだろうから。

ホモダイマーをSDS pageで泳動するとどうなるか？ 削除/引用 No.10299-1 - 2022/03/01 (火) 00:20:05 - ももんが 膜貫通型タンパクのホモダイマーを還元剤ありのSDS pageで泳動すると基本的にはモノマーになるのでしょうか。 モノマーにならないものもありますか？

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