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リン脂質の表示の仕方 トピック削除
No.10176-TOPIC - 2022/01/14 (金) 09:56:23 - debu
リン脂質で PC36:2のような表示を見かけますがどのような意味なのでしょうか?


脂肪酸の18:2のような表示は理解できるのですが。
上記の36:2の場合は脂肪酸のSN1とSN2がどのように表示されているのかわかりません(足し算?36は足し算だとしても:2が不明....)。というのが質問の意図です。

初心者質問でお見苦しい所見せてすみません。
 
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No.10176-5 - 2022/01/16 (日) 20:02:59 - にゅ
一般に脊椎動物のPCを構成する不飽和脂肪酸としてはオレイン酸(18:1n-9)が多いためにPC36:2(18:1/18:1)がmajorになります。時点でリノール酸を含む(18:0/18:2)だと思います。sn1位は確かに16:0や18:0といった飽和脂肪酸である場合が多いです(G3Pに脂肪酸を導入する酵素が飽和脂肪酸に対して特異なものがあるため)が、遊離脂肪酸の存在量如何で不飽和脂肪酸が入る場合もあります。こういった高度不飽和PCの存在量は少ないですが、組織によってはPC44:12(22:6/22:6)なんてものもあります。

(無題) 削除/引用
No.10176-4 - 2022/01/14 (金) 23:34:01 - debu
わかりやすい回答ありがとうございます。
sn1が飽和,sn2に不飽和が多いと記憶しているのですが、PC36:2(18:1/18:1)のように割り算計算になるのでしょうか?

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No.10176-3 - 2022/01/14 (金) 11:46:01 - にゅ
sn1位とsn2位の組み合わせがわからない場合にそのような表記をすると思います。基本的には不飽和結合数も足し算で、
PC36:2→(18:1/18:1)、(16:0/20:2)、(18:0/18:2)のような組み合わせがあると思います。

この時、LC-MS/MSで分析するときにPCのhead group(ホスホコリン、m/z=184)を標的として分子種を検出するときにはsn1/sn2の組み合わせは見ていないことになります。そのため足し算した表記が用いられます。(分子種ごとにピークのretention timeはずれるのでなんとなく識別はできます。)

とはいえ、おそらくその多くはPC36:2(18:1/18:1)だと思います。

(無題) 削除/引用
No.10176-2 - 2022/01/14 (金) 11:40:55 - qq
経験のない者が答えても仕方なのですが、、、
リン脂質をジアシルグリセロールにして?GC/MS、LC/MSで調べると、二つの脂肪酸が結合したものを測定することになると思うのですが、そうすると二つの脂肪酸の炭素数と二重結合の数は確定する。
オレイン酸二つかもしれないし、ステアリン酸とリノール酸かもしれないけど、それでよいということではないでしょうか。
MS/MSなどで詳細に調べれば、個々の脂肪酸の構造も分かるのかもしれないけど、そこまでするつもりはないということではないのかな?

リン脂質の表示の仕方 削除/引用
No.10176-1 - 2022/01/14 (金) 09:56:23 - debu
リン脂質で PC36:2のような表示を見かけますがどのような意味なのでしょうか?


脂肪酸の18:2のような表示は理解できるのですが。
上記の36:2の場合は脂肪酸のSN1とSN2がどのように表示されているのかわかりません(足し算?36は足し算だとしても:2が不明....)。というのが質問の意図です。

初心者質問でお見苦しい所見せてすみません。

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