BioTechnicalフォーラム [平均と補正]

平均と補正

No.10156-TOPIC - 2022/01/06 (木) 16:32:58 - まるこ

あるサンプルを3回同一条件で解析を行い、コントロールで補正をします。補正はコントロールの値を１として、3回行っています。（96wellでn=3）
この場合、まず3回分の平均値を出し、コントロールの平均値も出し、最後にサンプル平均値をコントロールの平均値で補正するのでしょうか？
あるいは、まずコントロールの平均値を出して、そのコントロール平均値でサンプルの各値を補正するのでしょうか？
両者で微妙に値が異なります。

またグラフを書く際にコントロールのグラフも入れたいのですが、その場合はコントロールのSDはなしでよいでしょうか？
　

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No.10156-6 - 2022/01/08 (土) 17:11:03 - FEN

＞サンプルの値それぞれに1.33を割っていって標準化する
＞コントロールも同様に1.33で割ってから、SDを計算する

そうだと思います。

(無題)

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No.10156-5 - 2022/01/08 (土) 16:39:08 - まるこ

みなさんご回答ありがとうございます。
今回ある細胞に異なる遺伝子を導入していて、空ベクター導入細胞をコントロールとしています。
対応がないと思いますので、例えばそのコントロールの細胞のある解析数値が1.5, 1.2, 1.3であれば、まず平均値1.33を計算し、サンプルの値それぞれに1.33を割っていって標準化すると思いますが、コントロールのSDはどのように示せばよいのでしょうか？
単純に1.5, 1.2, 1.3のSDをとれば良いのでしょうか？それともコントロールも同様に1.33で割ってから、SDを計算するのでしょうか？後者の方がしっくりきますが、、。

あとエクセルで計算する場合、このような細胞実験ではSTDEV.Sが一般的でしょうか？Sは抽出された標本の母集団の推定と認識しています。
よろしくお願い致します。

(無題)

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No.10156-4 - 2022/01/07 (金) 12:06:34 - seventh

3回測定というのがtechnical replicateなら平均値をそのサンプル（biological replicate）の測定値として扱えばよいと思います。
標準化についてはFEN様も言われているように対応のあるサンプルならそれぞれのcontrolを1として。contorlはすべて1になるのでSDは不要でしょう。
対応がないならcontrolの平均を1として各サンプルを標準化する。controlでもばらつきがあるのでSDは示したほうが良いです。

(無題)

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No.10156-3 - 2022/01/07 (金) 11:48:35 - FEN

例えば、同一サンプルで試薬投与前をコントロールとするならコントロールの値を１としてSD無しでも良いと思いますが、コントロールと元となるサンプル自体が異なる場合は、コントロール自体のバラつきも示すべきだと思います。

なので、コントロールの平均を１として、それを下に各コントロールを標準化してSDを求めておく方が良いと思いますけど。

ダメですか？？

(無題)

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No.10156-2 - 2022/01/07 (金) 04:12:56 - おお

相対的な測定をしているなら、毎回の実測値は絶対的な量とか活性とかを反映しないだろうから、コントロールの平均を出すのは意味がありません。この場合はコントロールを１としてTestの数値を求めたとして、SDなどはつけないでいいです。

毎回の数値が絶対的な数値を反映しているなら毎回の平均をとって、それを１として各コントロール、Testの値を平均値を基準に算出すればいいです。

平均と補正

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No.10156-1 - 2022/01/06 (木) 16:32:58 - まるこ

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